More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21460 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  100 
 
 		 267 aa  533  1e-151  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  58.05 
 
 		 263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  54.37 
 
 		 261 aa  291  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1304  ATP synthase F0, A subunit  37.08 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000065102  normal  0.293813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  36.86 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  35.66 
 
 		 275 aa  122  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  39.07 
 
 		 261 aa  122  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  32.08 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  37.79 
 
 		 249 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  33.49 
 
 		 303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  37.33 
 
 		 249 aa  118  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  34.12 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  36.97 
 
 		 259 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  35.98 
 
 		 250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  37.67 
 
 		 249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  34.4 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  33.07 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  33.86 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  36.49 
 
 		 248 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  31.52 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  30.56 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  33.59 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  31.91 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  33.18 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  30.4 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  35.04 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  34.14 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  36.55 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  34.34 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  34.73 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  33.85 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  36.49 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  36.64 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 		 272 aa  108  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  34.23 
 
 		 373 aa  108  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  33.8 
 
 		 266 aa  108  9.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  32.54 
 
 		 247 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  39.37 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  32.41 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  35.09 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  33.46 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  32.08 
 
 		 295 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  33.18 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  33.18 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  31.76 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  33.86 
 
 		 281 aa  105  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  29.91 
 
 		 251 aa  105  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  35.05 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  29.34 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  32.71 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  34.4 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  34.29 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  31.32 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0170  ATP synthase F0, A subunit  37.23 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.222204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  32.87 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  32.87 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  29.91 
 
 		 251 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  31.38 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  29.91 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  29.91 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  31.38 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  31.38 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  35.93 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1515  ATP synthase F0, A subunit  30.57 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  31.34 
 
 		 342 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  35.16 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  37.95 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  33.63 
 
 		 260 aa  99  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  32.78 
 
 		 345 aa  99  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  34.05 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  32.05 
 
 		 341 aa  97.4  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  29.89 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  35.16 
 
 		 266 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  32.13 
 
 		 249 aa  95.9  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  33.03 
 
 		 261 aa  95.5  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  28.82 
 
 		 226 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  28.82 
 
 		 226 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  30.12 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  33.61 
 
 		 276 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  31.31 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  29.52 
 
 		 226 aa  94.4  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  30.63 
 
 		 340 aa  92.8  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  28.33 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0723  F0F1 ATP synthase subunit A  30.18 
 
 		 228 aa  92.4  6e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  31 
 
 		 227 aa  92.8  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  31.02 
 
 		 263 aa  92.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  25.43 
 
 		 312 aa  92  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  27.78 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  32.92 
 
 		 339 aa  91.7  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  35.64 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  33.19 
 
 		 234 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  31.56 
 
 		 225 aa  91.3  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  32.56 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  32.68 
 
 		 400 aa  90.5  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  30.77 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0142  ATP synthase F0, A subunit  29.12 
 
 		 284 aa  90.5  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  30.21 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  29 
 
 		 338 aa  90.1  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  28.97 
 
 		 285 aa  89.4  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  27.47 
 
 		 226 aa  89.4  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>