More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21400 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  69.5 
 
 		 465 aa  635    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.97 
 
 		 464 aa  637    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.18 
 
 		 468 aa  644    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1045  ATP synthase F1, beta subunit  91.84 
 
 		 483 aa  886    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.711777  normal  0.102088 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1298  ATP synthase F1, beta subunit  76.29 
 
 		 493 aa  711    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.713648 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.18 
 
 		 468 aa  644    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 		 482 aa  635    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.6 
 
 		 469 aa  635    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  69.87 
 
 		 467 aa  652    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.67 
 
 		 473 aa  641    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.67 
 
 		 473 aa  640    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.79 
 
 		 462 aa  640    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.53 
 
 		 468 aa  638    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12050  ATP synthase, F1 beta subunit  86.4 
 
 		 479 aa  854    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.53 
 
 		 468 aa  637    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21400  ATP synthase, F1 beta subunit  100 
 
 		 485 aa  988    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  68.88 
 
 		 471 aa  634    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.24 
 
 		 472 aa  632  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.39 
 
 		 469 aa  633  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.39 
 
 		 469 aa  633  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.39 
 
 		 469 aa  633  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.39 
 
 		 469 aa  633  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 		 470 aa  632  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.39 
 
 		 469 aa  632  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 		 470 aa  632  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  66.03 
 
 		 470 aa  629  1e-179  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.81 
 
 		 470 aa  624  1e-178  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  66.04 
 
 		 482 aa  626  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 467 aa  622  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 		 462 aa  623  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  63.54 
 
 		 487 aa  622  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.44 
 
 		 465 aa  623  1e-177  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.44 
 
 		 465 aa  622  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.32 
 
 		 504 aa  622  1e-177  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.83 
 
 		 470 aa  620  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.69 
 
 		 470 aa  618  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl115  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.22 
 
 		 479 aa  619  1e-176  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 		 468 aa  620  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 		 468 aa  619  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.61 
 
 		 470 aa  618  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.09 
 
 		 462 aa  619  1e-176  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3711  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.61 
 
 		 483 aa  618  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.808218  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.69 
 
 		 470 aa  619  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 		 480 aa  620  1e-176  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 		 468 aa  619  1e-176  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.02 
 
 		 471 aa  619  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.44 
 
 		 462 aa  619  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3657  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.61 
 
 		 483 aa  618  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.47 
 
 		 462 aa  615  1e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.23 
 
 		 476 aa  617  1e-175  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0073  ATP synthase F1, beta subunit  64.23 
 
 		 501 aa  617  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11644  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.47 
 
 		 471 aa  616  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5090  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.37 
 
 		 482 aa  617  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.32 
 
 		 476 aa  617  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.87 
 
 		 462 aa  616  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.3 
 
 		 470 aa  615  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  66.01 
 
 		 468 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 		 470 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.88 
 
 		 475 aa  613  9.999999999999999e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.01 
 
 		 482 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.23 
 
 		 462 aa  611  9.999999999999999e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.87 
 
 		 470 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  66.74 
 
 		 464 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.37 
 
 		 465 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.9 
 
 		 471 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.69 
 
 		 519 aa  612  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.73 
 
 		 469 aa  612  9.999999999999999e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.56 
 
 		 468 aa  608  1e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.52 
 
 		 472 aa  610  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.09 
 
 		 481 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6062  ATP synthase F1, beta subunit  64.72 
 
 		 481 aa  609  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.58 
 
 		 464 aa  610  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.9 
 
 		 474 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3845  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.37 
 
 		 458 aa  609  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208529 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.81 
 
 		 465 aa  608  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.38 
 
 		 473 aa  610  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.12 
 
 		 475 aa  608  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.61 
 
 		 471 aa  608  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.23 
 
 		 458 aa  607  9.999999999999999e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1181  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 468 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.186447  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  65.06 
 
 		 503 aa  606  9.999999999999999e-173  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4507  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.23 
 
 		 463 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0605714 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4310  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.23 
 
 		 463 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000158553 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1273  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 468 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  65.52 
 
 		 470 aa  605  9.999999999999999e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.23 
 
 		 463 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.08 
 
 		 457 aa  607  9.999999999999999e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.86 
 
 		 463 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.23 
 
 		 463 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.93 
 
 		 463 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.145707 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0653  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.63 
 
 		 490 aa  604  9.999999999999999e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.903805 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54086  predicted protein  65.97 
 
 		 501 aa  607  9.999999999999999e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0980495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.4 
 
 		 471 aa  608  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.15 
 
 		 462 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4100  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.23 
 
 		 460 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.740687  normal  0.359635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0512  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.77 
 
 		 471 aa  601  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399895 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0144  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.66 
 
 		 464 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.801647  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.09 
 
 		 463 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.88 
 
 		 481 aa  602  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4262  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.23 
 
 		 460 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.227124  normal  0.244926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>