More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21210 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 
867 aa  1758    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.19 
 
 
778 aa  340  8e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.42 
 
 
800 aa  339  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.15 
 
 
598 aa  326  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.25 
 
 
837 aa  325  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.45 
 
 
623 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  41.24 
 
 
561 aa  321  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.27 
 
 
623 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  61.45 
 
 
251 aa  319  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  61.35 
 
 
252 aa  312  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  36.24 
 
 
655 aa  312  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  32.73 
 
 
663 aa  308  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1378  precorrin-3B C17-methyltransferase  62.5 
 
 
242 aa  303  7.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.83 
 
 
629 aa  300  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.3 
 
 
631 aa  296  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  35.75 
 
 
537 aa  294  4e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.73 
 
 
612 aa  283  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  36.13 
 
 
579 aa  276  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  35.88 
 
 
594 aa  275  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1275  precorrin-3B C17-methyltransferase  56.02 
 
 
244 aa  275  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.158636  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  32.8 
 
 
593 aa  274  7e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  34.41 
 
 
620 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  32.62 
 
 
593 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.06 
 
 
577 aa  270  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1377  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  40.76 
 
 
351 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  51 
 
 
253 aa  266  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.45 
 
 
574 aa  264  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  30.04 
 
 
604 aa  260  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  30.55 
 
 
606 aa  259  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1273  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  43.7 
 
 
340 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.23 
 
 
254 aa  254  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.01 
 
 
248 aa  254  6e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  28.85 
 
 
600 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  29.44 
 
 
600 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 
257 aa  248  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 
257 aa  247  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.39 
 
 
264 aa  247  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 
257 aa  247  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.19 
 
 
258 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.6 
 
 
257 aa  246  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.79 
 
 
251 aa  244  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.39 
 
 
251 aa  244  7e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.6 
 
 
257 aa  243  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.4 
 
 
258 aa  243  9e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.38 
 
 
252 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.21 
 
 
249 aa  240  6.999999999999999e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.8 
 
 
258 aa  237  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.6 
 
 
248 aa  237  7e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.8 
 
 
261 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  51 
 
 
261 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1317  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.5 
 
 
611 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161327  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.02 
 
 
260 aa  233  9e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.58 
 
 
253 aa  233  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.6 
 
 
261 aa  233  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  49.79 
 
 
241 aa  232  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1296  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.37 
 
 
240 aa  232  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.8 
 
 
259 aa  231  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.56 
 
 
251 aa  231  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.22 
 
 
256 aa  230  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.21 
 
 
255 aa  229  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  31.48 
 
 
574 aa  228  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.2 
 
 
250 aa  227  7e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2149  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.79 
 
 
241 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482473  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.28 
 
 
243 aa  226  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2249  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.79 
 
 
241 aa  226  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.209455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1300  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.27 
 
 
253 aa  226  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.37 
 
 
241 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0175  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.97 
 
 
601 aa  226  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120567  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.52 
 
 
958 aa  225  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2362  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.37 
 
 
241 aa  225  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  0.738043 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2196  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.37 
 
 
241 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  49.61 
 
 
772 aa  224  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  49.21 
 
 
776 aa  224  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.61 
 
 
254 aa  223  9e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2709  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.37 
 
 
236 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.424335  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1015  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.06 
 
 
240 aa  223  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.06 
 
 
257 aa  222  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.71 
 
 
254 aa  222  3e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.18 
 
 
252 aa  221  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.18 
 
 
257 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.9 
 
 
254 aa  221  5e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1234  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.55 
 
 
240 aa  221  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0777573  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.49 
 
 
610 aa  221  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1428  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.55 
 
 
240 aa  221  6e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0114869  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4821  precorrin-3 methyltransferase  35.91 
 
 
579 aa  218  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645584 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0935  precorrin-3 methyltransferase  46.44 
 
 
238 aa  218  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0243766 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.43 
 
 
256 aa  218  5e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  44.31 
 
 
614 aa  217  7e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.12 
 
 
272 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.88 
 
 
273 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.05 
 
 
626 aa  215  3.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  46 
 
 
626 aa  215  3.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  48.19 
 
 
777 aa  213  9e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.31 
 
 
268 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  52.7 
 
 
797 aa  212  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2500  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.15 
 
 
263 aa  213  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  44.66 
 
 
257 aa  211  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.94 
 
 
254 aa  211  7e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0216  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.18 
 
 
284 aa  210  8e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.55 
 
 
261 aa  210  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>