More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21140 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  100 
 
 		 508 aa  1022    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  55.53 
 
 		 513 aa  600  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  56.89 
 
 		 514 aa  597  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  49.41 
 
 		 494 aa  500  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  48.04 
 
 		 507 aa  476  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  51.27 
 
 		 506 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  50.68 
 
 		 506 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  50.88 
 
 		 513 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  51.07 
 
 		 506 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  50.88 
 
 		 506 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  48.73 
 
 		 503 aa  466  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  48.74 
 
 		 506 aa  463  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  47.95 
 
 		 503 aa  460  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  47.45 
 
 		 501 aa  453  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  48.64 
 
 		 515 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  48.23 
 
 		 517 aa  449  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  48.33 
 
 		 514 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  48.43 
 
 		 494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  45.88 
 
 		 772 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  47.25 
 
 		 864 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  46.27 
 
 		 512 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  47.27 
 
 		 496 aa  413  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  47.97 
 
 		 518 aa  415  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  45.54 
 
 		 491 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  45.28 
 
 		 776 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  44.94 
 
 		 514 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  43.14 
 
 		 487 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  43.34 
 
 		 487 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  45.42 
 
 		 863 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  46.95 
 
 		 539 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  45.28 
 
 		 495 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  43.27 
 
 		 484 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  47.32 
 
 		 551 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  42.52 
 
 		 500 aa  402  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  42.44 
 
 		 495 aa  395  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  46.48 
 
 		 509 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  44.47 
 
 		 534 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  44.47 
 
 		 489 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  41.92 
 
 		 485 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  45.26 
 
 		 503 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  44.23 
 
 		 858 aa  387  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  43.5 
 
 		 491 aa  388  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  44.79 
 
 		 863 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  44.38 
 
 		 512 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  44.79 
 
 		 503 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2177  cobyric acid synthase CobQ  44.73 
 
 		 561 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  45.31 
 
 		 481 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  44.79 
 
 		 797 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  41.81 
 
 		 536 aa  385  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  43.2 
 
 		 485 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  42.66 
 
 		 534 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  42.61 
 
 		 787 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  43.69 
 
 		 509 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  43.96 
 
 		 529 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  41.79 
 
 		 541 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  42.38 
 
 		 493 aa  385  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  43.9 
 
 		 502 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  40.88 
 
 		 475 aa  382  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  44.73 
 
 		 486 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  45.14 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  45.08 
 
 		 535 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  45.73 
 
 		 495 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  45.1 
 
 		 485 aa  382  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  41.43 
 
 		 527 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3731  cobyric acid synthase  41.32 
 
 		 554 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.699118  normal  0.182347 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  41.55 
 
 		 500 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  42.86 
 
 		 488 aa  381  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  41.6 
 
 		 541 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  45.27 
 
 		 487 aa  377  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  42.03 
 
 		 510 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  44.03 
 
 		 511 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  44.88 
 
 		 512 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  44.88 
 
 		 585 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  44.14 
 
 		 491 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  43.6 
 
 		 490 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  44.88 
 
 		 531 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  43.79 
 
 		 502 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  44.88 
 
 		 529 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  42.55 
 
 		 490 aa  378  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  41.49 
 
 		 541 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  42.21 
 
 		 523 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  45.08 
 
 		 545 aa  379  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  43.6 
 
 		 490 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  44.88 
 
 		 523 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  43.75 
 
 		 490 aa  376  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  41.26 
 
 		 777 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  43.72 
 
 		 484 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  43.71 
 
 		 486 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  44.55 
 
 		 486 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  45.04 
 
 		 520 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  44.07 
 
 		 852 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  43.7 
 
 		 498 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  46.05 
 
 		 495 aa  374  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  43.72 
 
 		 484 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  41.97 
 
 		 534 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  45.33 
 
 		 484 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  43.48 
 
 		 485 aa  372  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  42.91 
 
 		 484 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  43.66 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  42.91 
 
 		 483 aa  372  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>