More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20920 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_20920  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 195 aa  397  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24880  GTP cyclohydrolase I  76.47 
 
 		 194 aa  291  3e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0624  GTP cyclohydrolase I  68.25 
 
 		 195 aa  272  2.0000000000000002e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  65.22 
 
 		 185 aa  244  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  65.95 
 
 		 202 aa  244  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  65.22 
 
 		 188 aa  241  5e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  64.67 
 
 		 186 aa  240  9e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0539  GTP cyclohydrolase I  65.59 
 
 		 205 aa  240  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  64.52 
 
 		 202 aa  240  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  66.3 
 
 		 190 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  62.63 
 
 		 257 aa  237  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  61.9 
 
 		 206 aa  236  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24770  GTP cyclohydrolase I  63.93 
 
 		 195 aa  236  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2203  GTP cyclohydrolase I  62.7 
 
 		 187 aa  236  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  61.62 
 
 		 188 aa  235  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  63.1 
 
 		 201 aa  235  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  63.1 
 
 		 201 aa  235  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  63.1 
 
 		 201 aa  235  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  65.45 
 
 		 207 aa  234  6e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  63.24 
 
 		 202 aa  234  8e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4315  GTP cyclohydrolase  61.58 
 
 		 217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  64.67 
 
 		 187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  66.49 
 
 		 210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  61.08 
 
 		 220 aa  231  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  62.96 
 
 		 194 aa  230  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  61.98 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  59.46 
 
 		 188 aa  229  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0315  GTP cyclohydrolase I  59.04 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  62.5 
 
 		 206 aa  229  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  58.08 
 
 		 200 aa  229  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2153  GTP cyclohydrolase I  60.87 
 
 		 188 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  61.08 
 
 		 192 aa  229  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2986  GTP cyclohydrolase I  62.37 
 
 		 202 aa  228  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.472949  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0836  GTP cyclohydrolase I  59.57 
 
 		 214 aa  227  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0812961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  61.08 
 
 		 198 aa  227  7e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  59.68 
 
 		 189 aa  227  8e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  61.26 
 
 		 193 aa  227  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0628  GTP cyclohydrolase I  63.68 
 
 		 216 aa  226  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00907576  normal  0.596235 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  63.78 
 
 		 209 aa  226  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  60.96 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  60.87 
 
 		 185 aa  226  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  60.54 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  60.53 
 
 		 200 aa  226  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  58.92 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  60.3 
 
 		 205 aa  225  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  58.6 
 
 		 189 aa  225  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  58.6 
 
 		 189 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  58.6 
 
 		 189 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1421  GTP cyclohydrolase I  58.6 
 
 		 189 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0305505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1393  GTP cyclohydrolase I  58.6 
 
 		 189 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000458724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  58.6 
 
 		 189 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1567  GTP cyclohydrolase I  58.6 
 
 		 189 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  58.6 
 
 		 189 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  58.6 
 
 		 189 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000600048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  58.6 
 
 		 189 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  61.41 
 
 		 188 aa  224  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  58.06 
 
 		 219 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  56.83 
 
 		 187 aa  221  4e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  62.43 
 
 		 199 aa  221  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1171  GTP cyclohydrolase  59.44 
 
 		 198 aa  221  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.121032  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  59.14 
 
 		 219 aa  220  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  60.3 
 
 		 200 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  58.38 
 
 		 189 aa  218  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  60.11 
 
 		 234 aa  218  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  58.38 
 
 		 198 aa  218  6e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12810  GTP cyclohydrolase I  60.33 
 
 		 188 aa  216  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  56.22 
 
 		 189 aa  214  7e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  56.22 
 
 		 189 aa  213  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  55.68 
 
 		 189 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0977  GTP cyclohydrolase I  57.53 
 
 		 207 aa  211  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  55.38 
 
 		 227 aa  211  4.9999999999999996e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2817  GTP cyclohydrolase I  56.99 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7919  GTP cyclohydrolase I  56.5 
 
 		 202 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.907663  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1096  GTP cyclohydrolase I  52.69 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1274  GTP cyclohydrolase I  52.69 
 
 		 185 aa  205  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000261815  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1850  GTP cyclohydrolase I  56.04 
 
 		 199 aa  205  4e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.892033  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  52.31 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  56.35 
 
 		 219 aa  192  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  51.58 
 
 		 235 aa  193  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  54.97 
 
 		 213 aa  192  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  54.39 
 
 		 213 aa  191  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  51.58 
 
 		 239 aa  191  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  51.58 
 
 		 239 aa  191  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  52.49 
 
 		 219 aa  191  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  55.06 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  52.33 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  53.98 
 
 		 214 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  53.98 
 
 		 214 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  52.15 
 
 		 235 aa  189  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  54.95 
 
 		 219 aa  189  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  53.98 
 
 		 235 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  54.8 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  51.26 
 
 		 220 aa  188  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  47.96 
 
 		 234 aa  188  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  51.38 
 
 		 219 aa  188  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  54.55 
 
 		 216 aa  187  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  53.93 
 
 		 223 aa  187  7e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  52.91 
 
 		 179 aa  187  9e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  51.58 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  54.8 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>