137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20020 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_20020  thymidylate synthase (FAD)  100 
 
 
226 aa  471  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1128  thymidylate synthase, flavin-dependent  82.67 
 
 
226 aa  387  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.307637  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09250  thymidylate synthase (FAD)  70.8 
 
 
226 aa  340  7e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0981097  normal  0.0643636 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3806  FAD-dependent thymidylate synthase  61.01 
 
 
229 aa  277  7e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3106  FAD-dependent thymidylate synthase  59.36 
 
 
232 aa  275  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0378  FAD-dependent thymidylate synthase  58.26 
 
 
231 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000606523  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1027  FAD-dependent thymidylate synthase  56.68 
 
 
230 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00194248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3711  FAD-dependent thymidylate synthase  60.09 
 
 
229 aa  271  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000128726  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4063  FAD-dependent thymidylate synthase  55.96 
 
 
229 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000544981  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2649  FAD-dependent thymidylate synthase  54.13 
 
 
245 aa  258  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000329367  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2693  FAD-dependent thymidylate synthase  56.22 
 
 
228 aa  254  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000328347  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0802  thymidylate synthase, flavin-dependent  55.09 
 
 
218 aa  244  6.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150033  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2735  FAD-dependent thymidylate synthase  50.43 
 
 
245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2421  FAD-dependent thymidylate synthase  50.43 
 
 
245 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0588955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0400  FAD-dependent thymidylate synthase  54.59 
 
 
234 aa  241  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037909  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2044  FAD-dependent thymidylate synthase  49.17 
 
 
263 aa  236  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000390103  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0819  thymidylate synthase, flavin-dependent  51.34 
 
 
231 aa  236  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000230738  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0195  FAD-dependent thymidylate synthase  53.28 
 
 
246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00699129  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0772  thymidylate synthase, flavin-dependent  46 
 
 
258 aa  228  4e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  51.6 
 
 
223 aa  220  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00980  thymidylate synthase, flavin-dependent  49.07 
 
 
228 aa  215  5e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0189  FAD-dependent thymidylate synthase  49.13 
 
 
245 aa  209  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.125611  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3206  FAD-dependent thymidylate synthase  49.58 
 
 
243 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2321  FAD-dependent thymidylate synthase  49.15 
 
 
248 aa  203  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294658  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0990  FAD-dependent thymidylate synthase  50.42 
 
 
245 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329805  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0028  thymidylate synthase, flavin-dependent  43.84 
 
 
281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0523  thymidylate synthase, flavin-dependent  45.81 
 
 
237 aa  170  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1297  thymidylate synthase, flavin-dependent  42.72 
 
 
260 aa  169  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1894  thymidylate synthase, flavin-dependent  42.16 
 
 
254 aa  165  5e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_002936  DET1489  thymidylate synthase, flavin-dependent  42.57 
 
 
195 aa  148  8e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1279  thymidylate synthase, flavin-dependent  42.57 
 
 
195 aa  147  9e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1265  thymidylate synthase, flavin-dependent  43.22 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1200  thymidylate synthase, flavin-dependent  37.99 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.001686  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1139  thymidylate synthase (FAD)  41.15 
 
 
282 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.421298  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1199  thymidylate synthase, flavin-dependent  37.44 
 
 
273 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1268  thymidylate synthase, flavin-dependent  37.44 
 
 
273 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908128  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1187  thymidylate synthase, flavin-dependent  40.62 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.933104 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2890  thymidylate synthase, flavin-dependent  38.2 
 
 
249 aa  129  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3813  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  40.21 
 
 
252 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3449  thymidylate synthase, flavin-dependent  40.21 
 
 
248 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3530  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  40.21 
 
 
257 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537663  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3445  thymidylate synthase  39.39 
 
 
253 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277161  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3547  FAD-dependent thymidylate synthase  44.71 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.583534  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2189  thymidylate synthase, flavin-dependent  43.53 
 
 
250 aa  116  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0584  thymidylate synthase complementing protein ThyX  36.41 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000716478  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4001  FAD-dependent thymidylate synthase  43.71 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0999655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1388  FAD-dependent thymidylate synthase  38.66 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3494  thymidylate synthase, flavin-dependent  35.64 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2386  FAD-dependent thymidylate synthase  43.11 
 
 
250 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4274  thymidylate synthase flavin-dependent  36.65 
 
 
250 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.933149  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12767  FAD-dependent thymidylate synthase  42.35 
 
 
250 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1346  FAD-dependent thymidylate synthase  38.14 
 
 
247 aa  111  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2401  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1195  FAD-dependent thymidylate synthase  45.88 
 
 
274 aa  108  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200813  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25280  FAD-dependent thymidylate synthase  38.42 
 
 
250 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0348718  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0173  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.65 
 
 
230 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000307587  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2102  FAD-dependent thymidylate synthase  42.61 
 
 
254 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2115  FAD-dependent thymidylate synthase  42.61 
 
 
254 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2161  FAD-dependent thymidylate synthase  42.61 
 
 
254 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298336  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2353  thymidylate synthase complementing protein ThyX  35.83 
 
 
233 aa  105  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.431052  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1744  thymidylate synthase, flavin-dependent  35.2 
 
 
216 aa  105  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246329  normal  0.887681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2236  FAD-dependent thymidylate synthase  42.35 
 
 
233 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000477574  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5811  FAD-dependent thymidylate synthase  38.27 
 
 
250 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2482  thymidylate synthase complementing protein ThyX  37.11 
 
 
232 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000421387  hitchhiker  0.00846096 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0508  thymidylate synthase complementing protein ThyX  40.15 
 
 
289 aa  99.4  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0486  FAD-dependent thymidylate synthase  33.92 
 
 
220 aa  96.7  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000214395  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1762  FAD-dependent thymidylate synthase  33.33 
 
 
206 aa  96.3  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0471  FAD-dependent thymidylate synthase  33.33 
 
 
220 aa  95.1  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000151559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2792  FAD-dependent thymidylate synthase  36.76 
 
 
285 aa  94  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0026  FAD-dependent thymidylate synthase  31.4 
 
 
207 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0053  FAD-dependent thymidylate synthase  31.4 
 
 
207 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0028  FAD-dependent thymidylate synthase  31.4 
 
 
207 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0011  FAD-dependent thymidylate synthase  30.92 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2633  thymidylate synthase (FAD)  34.43 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0928647  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0001  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.02 
 
 
204 aa  89.7  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.248117  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1336  FAD-dependent thymidylate synthase  32.57 
 
 
233 aa  89  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1148  thymidylate synthase, flavin-dependent  36.22 
 
 
267 aa  88.6  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.606793 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0062  FAD-dependent thymidylate synthase  31.11 
 
 
228 aa  88.6  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00428445 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1800  FAD-dependent thymidylate synthase  32.64 
 
 
206 aa  88.2  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0219748  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2063  FAD-dependent thymidylate synthase  31.48 
 
 
235 aa  85.9  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.828676  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1909  FAD-dependent thymidylate synthase  29.03 
 
 
229 aa  85.1  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1229  FAD-dependent thymidylate synthase  28.91 
 
 
261 aa  85.1  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1861  FAD-dependent thymidylate synthase  32.37 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.224616  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3898  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.83 
 
 
216 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.262304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2472  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.68 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000436575  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0769  thymidylate synthase, flavin-dependent  39.16 
 
 
244 aa  79  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.354412  normal  0.842984 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1753  thymidylate synthase, flavin-dependent  36.16 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1689  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.31 
 
 
260 aa  78.2  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.179029 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2027  thymidylate synthase (FAD)  33.02 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1882  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.06 
 
 
217 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0694605  normal  0.133921 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1387  thymidylate synthase complementing protein ThyX  31.1 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0493208  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0919  thymidylate synthase complementing protein ThyX  31.4 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0709  thymidylate synthase, flavin-dependent  36.26 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.62086  normal  0.337229 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0390  FAD-dependent thymidylate synthase  28.83 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00258676  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02661  FAD-dependent thymidylate synthase  26.51 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.314215  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0501  thymidylate synthase, flavin-dependent  34.13 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02651  FAD-dependent thymidylate synthase  26.67 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1625  thymidylate synthase, flavin-dependent  35.17 
 
 
253 aa  71.6  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00115057  normal  0.386894 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1609  FAD-dependent thymidylate synthase  25.89 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03211  FAD-dependent thymidylate synthase  25.89 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1441  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.52 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.637537 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>