More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19490 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  100 
 
 		 499 aa  1027    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  73.88 
 
 		 647 aa  767    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  63.11 
 
 		 771 aa  647    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1187  lysyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 533 aa  601  1e-170  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33244  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 491 aa  537  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 488 aa  531  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 561 aa  525  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 		 494 aa  528  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 		 510 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 495 aa  520  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 489 aa  521  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 		 494 aa  518  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  52.07 
 
 		 503 aa  514  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 573 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 497 aa  511  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 499 aa  509  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 496 aa  505  9.999999999999999e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 502 aa  505  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 515 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 515 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 		 502 aa  504  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 494 aa  504  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 509 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 495 aa  500  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  499  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 508 aa  499  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 504 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 499 aa  496  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 499 aa  495  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 499 aa  495  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 499 aa  495  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 499 aa  495  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 499 aa  495  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 504 aa  496  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 499 aa  495  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 499 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 496 aa  497  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 501 aa  495  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 499 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 499 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 493 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0406  lysyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 495 aa  493  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 489 aa  494  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  51.77 
 
 		 492 aa  488  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 494 aa  489  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 499 aa  490  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 499 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  51.88 
 
 		 491 aa  485  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 511 aa  485  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  51.56 
 
 		 492 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 491 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 573 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 573 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 		 1118 aa  484  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 501 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 503 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 508 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 513 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 513 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 501 aa  481  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 		 631 aa  479  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 489 aa  478  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 505 aa  477  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0190  lysyl-tRNA synthetase (class II)  50.2 
 
 		 496 aa  476  1e-133  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 504 aa  477  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 		 505 aa  472  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  50.4 
 
 		 505 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 505 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 505 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 505 aa  474  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 505 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0893  lysyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 		 514 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246749  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 508 aa  471  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 494 aa  473  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 		 524 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 505 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 505 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0958  lysyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 514 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 		 505 aa  472  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 		 508 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  50.4 
 
 		 505 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 505 aa  472  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 505 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 505 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 505 aa  472  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3975  lysyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 561 aa  473  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.761967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 		 505 aa  474  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 		 512 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 503 aa  474  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 505 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 505 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 494 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 492 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 490 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 532 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 508 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 508 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 508 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>