87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19410 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  100 
 
 
195 aa  403  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  46.2 
 
 
176 aa  161  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  35.52 
 
 
157 aa  91.7  6e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  44.44 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  34.24 
 
 
151 aa  77.8  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  47.5 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  43.75 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.76 
 
 
150 aa  72  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.11 
 
 
171 aa  70.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  32.58 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  41.25 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  35 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.4 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  45.45 
 
 
159 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  38.71 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  40 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  42.22 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  29.11 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  30.5 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  30.14 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  38.75 
 
 
157 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  25.27 
 
 
163 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  38.75 
 
 
157 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  28.26 
 
 
164 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  30.32 
 
 
174 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  25.95 
 
 
173 aa  62  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  25.41 
 
 
163 aa  61.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  24.73 
 
 
163 aa  61.2  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  27.72 
 
 
188 aa  60.8  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  38.75 
 
 
152 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03670  hypothetical protein  50.85 
 
 
86 aa  59.3  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  28.98 
 
 
186 aa  59.3  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.55 
 
 
164 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.49 
 
 
163 aa  59.3  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  31.29 
 
 
168 aa  58.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  31.55 
 
 
172 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  30.59 
 
 
168 aa  57.8  0.00000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.1 
 
 
170 aa  58.2  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  31.02 
 
 
172 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  31.02 
 
 
172 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  28.49 
 
 
148 aa  57.4  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  28.42 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.94 
 
 
163 aa  54.7  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  28.99 
 
 
160 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.11 
 
 
159 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  28.34 
 
 
182 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  28.96 
 
 
161 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.75 
 
 
173 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  38.75 
 
 
173 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.75 
 
 
173 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.51 
 
 
168 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  44.44 
 
 
163 aa  51.6  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.9 
 
 
164 aa  51.2  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.48 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  28.4 
 
 
171 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.94 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  27.81 
 
 
171 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.56 
 
 
182 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  50 
 
 
196 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  27.81 
 
 
171 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.96 
 
 
166 aa  48.9  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  26.84 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  38.37 
 
 
160 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  40.32 
 
 
190 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  27.84 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  28.3 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.7 
 
 
165 aa  46.6  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  30.68 
 
 
181 aa  46.2  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  37.68 
 
 
178 aa  45.8  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  39.66 
 
 
196 aa  45.8  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  21.2 
 
 
163 aa  45.1  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  36.96 
 
 
173 aa  44.7  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.27 
 
 
167 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  27.33 
 
 
179 aa  43.9  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.34 
 
 
210 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.43 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  29.47 
 
 
171 aa  43.5  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  21.84 
 
 
181 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  42.59 
 
 
154 aa  42.4  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.72 
 
 
162 aa  42.4  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.53 
 
 
167 aa  42  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4666  phosphodiesterase  21.43 
 
 
178 aa  42  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.62 
 
 
186 aa  42  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.56 
 
 
170 aa  42  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  25.65 
 
 
165 aa  41.6  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  49.02 
 
 
189 aa  41.6  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  24.74 
 
 
177 aa  41.2  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>