227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19180 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  282  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0941  transcriptional regulator, XRE family  46.81 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.551097  normal  0.0671843 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  47.79 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0422  transcriptional regulator  33.57 
 
 		 146 aa  83.6  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0194  hypothetical protein  42.86 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375729 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 505 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 321 aa  52.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  35 
 
 		 263 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  38.6 
 
 		 301 aa  51.2  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  36.47 
 
 		 200 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 209 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  41.67 
 
 		 359 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  38.33 
 
 		 229 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 68 aa  48.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  38.24 
 
 		 209 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  40.32 
 
 		 227 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  37.1 
 
 		 206 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  37.21 
 
 		 196 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  37.66 
 
 		 272 aa  47.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  30.59 
 
 		 347 aa  47.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  42.86 
 
 		 342 aa  47.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 210 aa  47.4  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 197 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  36.67 
 
 		 229 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  36.67 
 
 		 229 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 281 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  34.48 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  32.65 
 
 		 403 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 497 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 346 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06250  predicted transcriptional regulator  28.12 
 
 		 256 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  43.86 
 
 		 259 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  49.06 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4795  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0939257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  32.65 
 
 		 403 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  38.71 
 
 		 255 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  26.62 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 276 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0045  PbsX family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  33.33 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  33.33 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  33.9 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 212 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0666  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  36 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 359 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0039  PbsX family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.35 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3686  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 490 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  38.1 
 
 		 234 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.35 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2408  transcriptional regulator, XRE family  25.69 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0754748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  37.18 
 
 		 403 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 403 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 403 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 176 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  37.18 
 
 		 403 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 229 aa  43.9  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  32.53 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  30.65 
 
 		 209 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2157  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.34 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  37.18 
 
 		 403 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  35.59 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  37.14 
 
 		 459 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  32.26 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  37.93 
 
 		 216 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 256 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0154  helix-turn-helix domain-containing protein  39.34 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.35 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 404 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>