More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19060 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  54.79 
 
 		 675 aa  651    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  100 
 
 		 586 aa  1207    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  51.38 
 
 		 580 aa  608  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  49.04 
 
 		 611 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  48.94 
 
 		 607 aa  558  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  47.49 
 
 		 569 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  46.71 
 
 		 583 aa  536  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  51.88 
 
 		 661 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  53.68 
 
 		 661 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  52.83 
 
 		 658 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  52.83 
 
 		 659 aa  509  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  52.71 
 
 		 661 aa  504  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  44.59 
 
 		 589 aa  503  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  44.29 
 
 		 592 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  47.8 
 
 		 806 aa  489  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  48.52 
 
 		 777 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  52 
 
 		 655 aa  488  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  44.69 
 
 		 587 aa  488  1e-136  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  40.92 
 
 		 644 aa  482  1e-135  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  49.89 
 
 		 663 aa  480  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  51.03 
 
 		 673 aa  481  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  49.06 
 
 		 680 aa  476  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  48.8 
 
 		 683 aa  474  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  50.1 
 
 		 661 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  47.82 
 
 		 676 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  47.56 
 
 		 673 aa  467  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  47.82 
 
 		 676 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  45.93 
 
 		 670 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  45.34 
 
 		 676 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  42.63 
 
 		 708 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  43.74 
 
 		 725 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  41.41 
 
 		 608 aa  425  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  43.08 
 
 		 728 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  44.73 
 
 		 659 aa  421  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  45.3 
 
 		 686 aa  412  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  43.97 
 
 		 552 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  39.09 
 
 		 799 aa  400  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  41.51 
 
 		 709 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  37.5 
 
 		 647 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  40.35 
 
 		 783 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  35.19 
 
 		 636 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  41.96 
 
 		 778 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  40.5 
 
 		 794 aa  369  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  40.88 
 
 		 793 aa  369  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  39.65 
 
 		 787 aa  359  7e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  42.31 
 
 		 675 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  38.7 
 
 		 829 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  41.72 
 
 		 710 aa  355  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  42.39 
 
 		 675 aa  355  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  40 
 
 		 677 aa  350  5e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  42.63 
 
 		 790 aa  348  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  40.37 
 
 		 793 aa  345  1e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  38.42 
 
 		 725 aa  341  2e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  39.27 
 
 		 763 aa  330  3e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  39.84 
 
 		 691 aa  322  9.999999999999999e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  45.58 
 
 		 316 aa  266  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  60 
 
 		 371 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  30.8 
 
 		 697 aa  194  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  29.48 
 
 		 587 aa  158  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  28.69 
 
 		 523 aa  158  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  28.69 
 
 		 508 aa  158  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  28.1 
 
 		 495 aa  157  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  27.99 
 
 		 574 aa  157  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  28.27 
 
 		 633 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  27.86 
 
 		 574 aa  154  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  27.62 
 
 		 574 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  26.7 
 
 		 516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  27 
 
 		 498 aa  148  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  26.53 
 
 		 496 aa  146  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  23.72 
 
 		 505 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1213  type I restriction-modification system specificity subunit  43.09 
 
 		 196 aa  140  6e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  30.03 
 
 		 585 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  25.51 
 
 		 527 aa  139  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  25.6 
 
 		 522 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  25.52 
 
 		 822 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  25.05 
 
 		 506 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  26.5 
 
 		 513 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  26.03 
 
 		 495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  25.87 
 
 		 501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  26.4 
 
 		 494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  27.14 
 
 		 522 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  27.31 
 
 		 500 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  26.38 
 
 		 808 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3989  N-6 DNA methylase  41.29 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  29.38 
 
 		 527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  26 
 
 		 499 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  24.57 
 
 		 526 aa  131  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  24.95 
 
 		 891 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  25.11 
 
 		 544 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  26.02 
 
 		 816 aa  128  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  26.73 
 
 		 522 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  25.85 
 
 		 499 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  23.33 
 
 		 511 aa  127  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  26.05 
 
 		 498 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  26.9 
 
 		 499 aa  126  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  25.37 
 
 		 516 aa  123  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  26.32 
 
 		 493 aa  123  9e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  30.1 
 
 		 908 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  25.87 
 
 		 520 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  25.87 
 
 		 520 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>