More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18950 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  100 
 
 		 556 aa  1118    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  69.67 
 
 		 524 aa  502  1e-141  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  66.98 
 
 		 535 aa  473  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  52.04 
 
 		 256 aa  114  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  53.06 
 
 		 271 aa  113  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  48.65 
 
 		 259 aa  107  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19600  hypothetical protein  49.07 
 
 		 411 aa  106  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.652812  hitchhiker  0.00117043 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  54.74 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  51.49 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  48.18 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  45.22 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  51.65 
 
 		 278 aa  100  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  50 
 
 		 452 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50.52 
 
 		 332 aa  99  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  49 
 
 		 438 aa  96.7  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19530  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  49.57 
 
 		 442 aa  96.7  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000946719  hitchhiker  0.00000162886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  49.53 
 
 		 318 aa  96.3  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09120  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  54.12 
 
 		 313 aa  95.9  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  50.5 
 
 		 327 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  55 
 
 		 261 aa  95.1  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  50 
 
 		 385 aa  95.1  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 333 aa  94  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  50 
 
 		 257 aa  93.6  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 360 aa  92.4  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  43.86 
 
 		 281 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  54.32 
 
 		 317 aa  92.8  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  54 
 
 		 291 aa  91.3  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 265 aa  90.9  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  42.37 
 
 		 348 aa  90.9  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  43.1 
 
 		 331 aa  90.5  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  44.76 
 
 		 368 aa  90.5  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  48.45 
 
 		 388 aa  90.1  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  47.42 
 
 		 398 aa  89.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  44.17 
 
 		 319 aa  89.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  48.42 
 
 		 168 aa  87.4  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  50.51 
 
 		 362 aa  87.4  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  48.21 
 
 		 204 aa  87  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  52.38 
 
 		 269 aa  87  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  41.33 
 
 		 182 aa  87  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2028  NLP/P60 protein  44.74 
 
 		 233 aa  86.7  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  50.51 
 
 		 362 aa  87  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  44.23 
 
 		 325 aa  87  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  50.51 
 
 		 362 aa  87  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  40.59 
 
 		 205 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  39.64 
 
 		 216 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0021  NLP/P60 protein  47.47 
 
 		 165 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 208 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  43.43 
 
 		 226 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  44.94 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  46.79 
 
 		 191 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  42.71 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  42.71 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  44.44 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  42.71 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0978  NLP/P60 protein  56.34 
 
 		 384 aa  84.7  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6442  NLP/P60 protein  44.12 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  54.22 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  42.42 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1599  NLP/P60 protein  51.69 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  46.51 
 
 		 335 aa  82.8  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  42.4 
 
 		 349 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  36.73 
 
 		 234 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.62 
 
 		 235 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  36.73 
 
 		 234 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  36.73 
 
 		 234 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  36.73 
 
 		 218 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4838  NLP/P60 protein  57.53 
 
 		 359 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.11848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  36.73 
 
 		 218 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  36.73 
 
 		 218 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  36.73 
 
 		 234 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  36.73 
 
 		 218 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  39.34 
 
 		 188 aa  82  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  31.07 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  37.84 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  43.14 
 
 		 487 aa  82  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  40 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  36.73 
 
 		 221 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  39.34 
 
 		 188 aa  82  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  36.73 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  41.94 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  36.8 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  34.69 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  45.78 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2050  NLP/P60 protein  44 
 
 		 696 aa  80.9  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.426387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  34.69 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  41.94 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  34.69 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  34.69 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  43 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  43.3 
 
 		 297 aa  79.7  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 162 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  46.74 
 
 		 180 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  34.69 
 
 		 223 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  34.69 
 
 		 223 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  34.69 
 
 		 223 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  43.43 
 
 		 374 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>