12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18520 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_18520  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  446  1.0000000000000001e-124  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1004  hypothetical protein  37.67 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.222675 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17890  predicted membrane protein  41.96 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0780297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1591  hypothetical protein  39.46 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174735 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05630  hypothetical protein  36.91 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.502408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04300  Ferric reductase like transmembrane component  38.12 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00128485  normal  0.0690521 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20890  predicted membrane protein  37.72 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3048  membrane protein-like protein  40.66 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1102  hypothetical protein  25.76 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000717083  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1182  hypothetical protein  25.45 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000961119  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1013  hypothetical protein  24.68 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000440663  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03400  hypothetical protein  26.46 
 
 		 291 aa  43.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>