More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18300 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_18300  thioredoxin reductase  100 
 
 		 303 aa  617  1e-176  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  41.2 
 
 		 315 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  41.53 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  39.53 
 
 		 304 aa  229  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  41.2 
 
 		 306 aa  228  9e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  38.33 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  38 
 
 		 321 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  38 
 
 		 321 aa  225  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  38 
 
 		 321 aa  225  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  37.92 
 
 		 311 aa  225  6e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  37.67 
 
 		 318 aa  225  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  38 
 
 		 318 aa  225  8e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  38 
 
 		 318 aa  225  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  38 
 
 		 318 aa  225  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  38 
 
 		 318 aa  225  8e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  37.67 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  38 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  38.41 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  38.28 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  38.39 
 
 		 340 aa  217  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  39.8 
 
 		 317 aa  216  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  39.8 
 
 		 317 aa  216  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  39.14 
 
 		 304 aa  215  8e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  38.54 
 
 		 304 aa  212  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  40.07 
 
 		 306 aa  212  7e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  36.58 
 
 		 316 aa  211  9e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  37.09 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  37.42 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  36.54 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  37.62 
 
 		 306 aa  208  9e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  37 
 
 		 317 aa  207  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  39.53 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  38 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  38 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  35.95 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0566  thioredoxin reductase  35.94 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.302989  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  37.12 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  37.12 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.21 
 
 		 427 aa  206  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  38.24 
 
 		 547 aa  204  2e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0553  thioredoxin reductase  37.92 
 
 		 316 aa  202  4e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  36.45 
 
 		 310 aa  202  5e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.27 
 
 		 407 aa  202  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  37.42 
 
 		 333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  37.42 
 
 		 333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  36.12 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  36.72 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  37.42 
 
 		 333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1406  thioredoxin reductase  36.18 
 
 		 638 aa  200  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1200  thioredoxin reductase  39.72 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  35.88 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  35.64 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  38.21 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  35.88 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  36 
 
 		 396 aa  197  3e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  35.29 
 
 		 555 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  37.09 
 
 		 336 aa  196  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  35.67 
 
 		 309 aa  195  7e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.54 
 
 		 306 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  36.51 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  40.07 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  36.09 
 
 		 331 aa  193  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  36.09 
 
 		 332 aa  192  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2898  thioredoxin reductase (NADPH)  36.72 
 
 		 309 aa  191  9e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611748  hitchhiker  0.00113285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  38.21 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0401  Thioredoxin-disulfide reductase  41.06 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0543651 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.54 
 
 		 555 aa  190  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25100  thioredoxin reductase  36.94 
 
 		 552 aa  190  2.9999999999999997e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  36.33 
 
 		 319 aa  189  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  36.67 
 
 		 318 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0172  thioredoxin reductase  37.1 
 
 		 310 aa  187  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.454317  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  36.09 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  36.3 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  36.96 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  37.66 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  35.43 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0080  thioredoxin-disulfide reductase  38.87 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  36.04 
 
 		 361 aa  187  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  35.97 
 
 		 334 aa  186  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  36.42 
 
 		 321 aa  186  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  34.78 
 
 		 308 aa  185  6e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  34.44 
 
 		 309 aa  185  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  35.76 
 
 		 310 aa  185  9e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  38.36 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  36.57 
 
 		 308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1203  thioredoxin reductase  36.75 
 
 		 305 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0940141  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  34.52 
 
 		 409 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.61 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  33.77 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.05 
 
 		 551 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  39.53 
 
 		 391 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  37.34 
 
 		 324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.31 
 
 		 579 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  36.3 
 
 		 310 aa  182  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  34.98 
 
 		 311 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1411  thioredoxin reductase  37.22 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0214  thioredoxin-disulfide reductase  35.6 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.136255  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  35.76 
 
 		 317 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  35.76 
 
 		 322 aa  180  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  35.76 
 
 		 309 aa  179  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>