More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18240 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_18240  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  100 
 
 
226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  46.08 
 
 
230 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0439  ABC transporter related  45.41 
 
 
237 aa  192  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0164474  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  47.42 
 
 
251 aa  150  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  42.16 
 
 
254 aa  148  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  40.89 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 
250 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2035  ABC transporter related  41.1 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  42.13 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  43 
 
 
251 aa  145  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.37 
 
 
254 aa  146  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0995  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  48.6 
 
 
254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.37 
 
 
254 aa  145  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  33.91 
 
 
249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  43.13 
 
 
250 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.1 
 
 
256 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.1 
 
 
256 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  40.1 
 
 
257 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.1 
 
 
256 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.1 
 
 
256 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  40.1 
 
 
256 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.1 
 
 
256 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  42.79 
 
 
250 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  40.1 
 
 
256 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  43.15 
 
 
243 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  42.63 
 
 
258 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  43.78 
 
 
254 aa  142  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  39.69 
 
 
260 aa  142  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  39.9 
 
 
252 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  40.41 
 
 
252 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  38.65 
 
 
255 aa  141  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2618  ABC transporter related  43.06 
 
 
247 aa  141  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.314848  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
249 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  38.16 
 
 
252 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  40.78 
 
 
250 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  38.73 
 
 
248 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  36.5 
 
 
251 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 
256 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  41.86 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  40.31 
 
 
258 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  40.31 
 
 
258 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 
256 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  42 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  36.99 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  39.91 
 
 
262 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  38.76 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  37.79 
 
 
278 aa  138  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  34.89 
 
 
249 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  39.13 
 
 
256 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  34.89 
 
 
249 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  45.26 
 
 
250 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  35 
 
 
273 aa  138  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  36.32 
 
 
265 aa  138  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0130  ABC transporter related protein  34.86 
 
 
253 aa  137  8.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  37.5 
 
 
251 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  43.98 
 
 
247 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1546  ABC transporter related  43.59 
 
 
248 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 
249 aa  136  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  39.45 
 
 
252 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3806  ABC transporter related protein  32.27 
 
 
221 aa  136  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000628307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  37.5 
 
 
255 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  35.38 
 
 
262 aa  136  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  33.64 
 
 
280 aa  136  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  41.84 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  40.74 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  34.89 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0517  manganese transport system ATP-binding protein MntA  34.23 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  38.42 
 
 
254 aa  135  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  36.32 
 
 
263 aa  135  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  34.8 
 
 
239 aa  135  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  34.47 
 
 
249 aa  135  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3624  ABC transporter related  36.18 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  36.2 
 
 
255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  43.24 
 
 
262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  33.62 
 
 
259 aa  134  9e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  36.1 
 
 
240 aa  134  9e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2484  ABC transporter related  35.68 
 
 
246 aa  134  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  38.92 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  35.44 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0137  cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.63 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  40.1 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0155  cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.63 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  35.75 
 
 
252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  39.42 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3530  ABC transporter related  37.88 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  38.5 
 
 
271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2418  zinc ABC transporter ATP-binding protein  36.53 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0178  cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.15 
 
 
284 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2381  ABC transporter related protein  45.73 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722045  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  39.71 
 
 
249 aa  132  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  36.79 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  35.82 
 
 
252 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  41.54 
 
 
263 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  35.4 
 
 
247 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4740  ABC transporter related protein  44.5 
 
 
253 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  38.86 
 
 
262 aa  131  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  34.74 
 
 
259 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  37.22 
 
 
262 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  31.02 
 
 
249 aa  130  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  40.4 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>