20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17890 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_17890  predicted membrane protein  100 
 
 
223 aa  435  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0780297  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05630  hypothetical protein  52.47 
 
 
232 aa  198  5e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.502408  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1591  hypothetical protein  51.34 
 
 
227 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174735 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20890  predicted membrane protein  46.88 
 
 
238 aa  158  7e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3048  membrane protein-like protein  48.34 
 
 
236 aa  145  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1004  hypothetical protein  40.54 
 
 
229 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.222675 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04300  Ferric reductase like transmembrane component  38.57 
 
 
234 aa  126  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00128485  normal  0.0690521 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1102  hypothetical protein  32.46 
 
 
229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000717083  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18520  hypothetical protein  43.15 
 
 
229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1182  hypothetical protein  31.78 
 
 
224 aa  88.6  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000961119  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1013  hypothetical protein  32.02 
 
 
224 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000440663  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03400  hypothetical protein  27.83 
 
 
291 aa  57.4  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00240  hypothetical protein  28.43 
 
 
343 aa  55.5  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1135  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  34.88 
 
 
222 aa  48.9  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0776  ferric reductase-like transmembrane component-like  34.44 
 
 
216 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0694  Ferric reductase domain protein transmembrane component  39.06 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3632  putative sulfite oxidase subunit YedZ  31.58 
 
 
209 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0668  ferric reductase domain-containing protein  32.56 
 
 
219 aa  42.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2915  ferric reductase-like transmembrane component-like  29.76 
 
 
213 aa  43.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.250358  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0714  ferric reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
219 aa  41.6  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>