56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17840 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  100 
 
 
181 aa  378  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2092  GCN5-related N-acetyltransferase  29.22 
 
 
175 aa  86.3  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1244  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
177 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0357643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0950  GCN5-related N-acetyltransferase  28.39 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0935  acetyltransferase  21.64 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592178  normal  0.287398 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
176 aa  62.4  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.15187  normal  0.614512 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1497  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0348  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
189 aa  59.3  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000810741  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1619  acetyltransferase  27.08 
 
 
167 aa  58.2  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.20588  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1363  acetyltransferase  27.08 
 
 
167 aa  58.2  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.014486  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1183  acetyltransferase  27.39 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000821591  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1014  acetyltransferase  26.75 
 
 
170 aa  55.5  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000248844  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 
170 aa  55.1  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.561407 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  25.62 
 
 
173 aa  52.4  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2381  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
174 aa  49.3  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0546  acetyltransferase  24.07 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  unclonable  9.485090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4788  GCN5-related N-acetyltransferase  24.03 
 
 
173 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0916  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.58 
 
 
182 aa  48.5  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2093  acetyltransferase  26.67 
 
 
176 aa  48.5  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 
169 aa  48.1  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.307283  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0013  acetyltransferase  26.32 
 
 
176 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1885  acetyltransferase  26.32 
 
 
176 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0938  GCN5-related N-acetyltransferase  26.22 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000016136  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  24.68 
 
 
168 aa  45.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2616  GCN5-related N-acetyltransferase  29.76 
 
 
367 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.719016  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2322  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 
178 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0909  acetyltransferase  27.33 
 
 
154 aa  44.7  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2008  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
171 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1761  acetyltransferase  25.32 
 
 
191 aa  44.3  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  26.4 
 
 
139 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0777  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
368 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0826  putative acetyltransferase  38.18 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  26.36 
 
 
139 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.631639  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  23.42 
 
 
163 aa  43.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000829593  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1901  GCN5-related N-acetyltransferase  24.68 
 
 
170 aa  42.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2047  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
170 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  0.82296 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0926  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2805  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 
134 aa  42.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.121712  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2760  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 
134 aa  42.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1586  acetyltransferase  30.65 
 
 
130 aa  42.4  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.569606  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2120  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 
278 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.210858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5108  acetyltransferase, gnat family  24.03 
 
 
173 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3140  putative acetyltransferase  38.18 
 
 
156 aa  42  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0451024  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2840  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
157 aa  41.6  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000815597  normal  0.0271739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2953  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
343 aa  41.6  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1034  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
183 aa  41.6  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4258  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
172 aa  41.6  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1508  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
169 aa  41.6  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1479  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
169 aa  41.6  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.882533  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1585  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 
161 aa  41.6  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3942  acetyltransferase, GNAT family  37.1 
 
 
192 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000096173  decreased coverage  0.00543726 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1401  acetyltransferase, GNAT family  37.1 
 
 
192 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000159569  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0371  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35 
 
 
168 aa  41.2  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000312677 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0737  GCN5-related N-acetyltransferase  26.4 
 
 
161 aa  41.2  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.688854  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  25.58 
 
 
192 aa  41.2  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131374  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0994  acetyltransferase  27.03 
 
 
167 aa  40.8  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>