280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16510 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  100 
 
 		 351 aa  725    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  58.82 
 
 		 353 aa  420  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  56.14 
 
 		 345 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  53.2 
 
 		 372 aa  401  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  57 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2639  Radical SAM domain protein  53.5 
 
 		 374 aa  350  2e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  42.67 
 
 		 351 aa  280  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  46.85 
 
 		 349 aa  269  5e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1735  biotin synthase  50.7 
 
 		 350 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00262623  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  41.98 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  44.37 
 
 		 349 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  40.41 
 
 		 345 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  41.99 
 
 		 341 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  42.37 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  45.62 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  43.87 
 
 		 348 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  43.27 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  40.06 
 
 		 347 aa  236  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  43.62 
 
 		 344 aa  237  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  43.55 
 
 		 348 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000209115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  40.06 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  40.98 
 
 		 352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  37.46 
 
 		 346 aa  231  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  42.35 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  43 
 
 		 323 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  40.62 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  47.06 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  40.48 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  35.89 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  39.33 
 
 		 337 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  41.3 
 
 		 357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  36.52 
 
 		 380 aa  212  5.999999999999999e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  34.97 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  34.66 
 
 		 359 aa  206  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  0.000014228 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  39.46 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1504  biotin synthase  42.65 
 
 		 331 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  39.54 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  32.08 
 
 		 364 aa  186  7e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  27 
 
 		 365 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  29.3 
 
 		 368 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  28.1 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  27.37 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.27 
 
 		 477 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.19 
 
 		 473 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.81 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.15 
 
 		 471 aa  76.6  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  28.52 
 
 		 475 aa  76.3  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.41 
 
 		 466 aa  75.9  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.15 
 
 		 473 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  25.35 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.32 
 
 		 492 aa  73.6  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.07 
 
 		 484 aa  73.2  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1022  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.24 
 
 		 487 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  25 
 
 		 458 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.51 
 
 		 469 aa  72.8  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3253  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.42 
 
 		 479 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173942 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.82 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.26 
 
 		 469 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0708  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.34 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.519768  hitchhiker  0.000306942 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.64 
 
 		 471 aa  70.5  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.11 
 
 		 479 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.6 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.11 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.12 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.64 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.49 
 
 		 474 aa  66.6  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1607  biotin and thiamin synthesis associated  26.07 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.67 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  24.85 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1734  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.05 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.908145  normal  0.683505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.93 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00141  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.89 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.67 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  25 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  31.21 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.84 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1117  biotin and thiamin synthesis associated  28.12 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  23.97 
 
 		 335 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.39 
 
 		 469 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  23.97 
 
 		 335 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0273  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.8 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.11 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.34 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.51 
 
 		 490 aa  60.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.43 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  30.99 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  26.43 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  27.69 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.07 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1664  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.94 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.198557  hitchhiker  0.0013298 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  26.67 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.06 
 
 		 370 aa  57  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  25.82 
 
 		 340 aa  57  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4187  biotin synthase  25.09 
 
 		 363 aa  57  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.74 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  25.71 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  24.44 
 
 		 863 aa  56.6  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2231  biotin synthase  25.75 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2107  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.4 
 
 		 370 aa  55.8  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.55 
 
 		 458 aa  55.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>