More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16460 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  79.32 
 
 		 598 aa  953    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1463  ABC transporter related  77.82 
 
 		 597 aa  941    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 595 aa  1222    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  34.76 
 
 		 603 aa  363  6e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  34.7 
 
 		 603 aa  362  1e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  38.59 
 
 		 600 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  38.1 
 
 		 600 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  37.52 
 
 		 595 aa  347  4e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  35.48 
 
 		 594 aa  346  8e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  33.78 
 
 		 610 aa  345  8.999999999999999e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6186  multidrug ABC transporter ATPase/permease  37.29 
 
 		 605 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  35.65 
 
 		 593 aa  343  5.999999999999999e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  39.92 
 
 		 581 aa  342  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  33.44 
 
 		 610 aa  341  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  39.76 
 
 		 604 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1248  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  35.68 
 
 		 625 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  38.41 
 
 		 596 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.67 
 
 		 621 aa  340  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  34.69 
 
 		 599 aa  340  5e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2875  ABC transporter related  35.57 
 
 		 625 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216771  normal  0.111784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  36.67 
 
 		 595 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  36.12 
 
 		 637 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  36.12 
 
 		 637 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  39.23 
 
 		 599 aa  336  7e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  36.29 
 
 		 663 aa  336  7e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  38.79 
 
 		 601 aa  335  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  36.12 
 
 		 636 aa  335  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6143  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.96 
 
 		 603 aa  334  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  35.95 
 
 		 637 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  36.29 
 
 		 609 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.36 
 
 		 589 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  35.71 
 
 		 623 aa  332  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.36 
 
 		 621 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.36 
 
 		 621 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  37.36 
 
 		 621 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.36 
 
 		 621 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0712  ABC transporter related  36.77 
 
 		 596 aa  331  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0247864  normal  0.335635 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  35.6 
 
 		 637 aa  331  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.36 
 
 		 621 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.36 
 
 		 621 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  35.15 
 
 		 596 aa  330  4e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3044  ABC transporter related  38.95 
 
 		 637 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.989361  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  33.11 
 
 		 597 aa  329  7e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5858  ABC transporter related  37.1 
 
 		 591 aa  329  7e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  37.72 
 
 		 587 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2780  ABC transporter related  38.91 
 
 		 637 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0515  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  38.54 
 
 		 663 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0553  ABC transporter related  36.82 
 
 		 598 aa  328  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1637  ABC transporter related  40.57 
 
 		 630 aa  327  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135005  normal  0.475393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  35.32 
 
 		 630 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  35.37 
 
 		 643 aa  327  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  37.23 
 
 		 595 aa  327  5e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0953  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  39.8 
 
 		 669 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2524  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.8 
 
 		 669 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265455  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0942  ABC transporter related  36.76 
 
 		 622 aa  325  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  38.4 
 
 		 572 aa  325  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2665  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  39.8 
 
 		 669 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  38.43 
 
 		 620 aa  325  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1427  ABC transporter-like  39.32 
 
 		 610 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.582294  normal  0.104251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3233  ABC transporter related  38.97 
 
 		 599 aa  325  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1457  ABC transporter related  39.88 
 
 		 609 aa  324  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.162011  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2173  ABC transporter related  39.92 
 
 		 616 aa  324  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3695  ABC transporter related  37.97 
 
 		 603 aa  324  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1416  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.6 
 
 		 669 aa  324  4e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0233  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  39.6 
 
 		 669 aa  324  4e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1612  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  39.6 
 
 		 669 aa  324  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658136  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0270  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.6 
 
 		 669 aa  324  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  37.55 
 
 		 621 aa  323  5e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1260  hypothetical protein  34.7 
 
 		 582 aa  323  7e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.678722 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1622  ABC transporter related  40.2 
 
 		 621 aa  322  9.000000000000001e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327918  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  35.57 
 
 		 599 aa  322  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  33.84 
 
 		 633 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3208  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.96 
 
 		 625 aa  321  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333533  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  38.23 
 
 		 620 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.33 
 
 		 619 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  38 
 
 		 607 aa  320  3.9999999999999996e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4939  ABC transporter related  38.2 
 
 		 626 aa  320  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0739  ABC transporter related  40 
 
 		 613 aa  319  7.999999999999999e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327273  normal  0.0543304 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  38.38 
 
 		 609 aa  319  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0242  ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 		 706 aa  318  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1451  ABC transporter-related protein  38.31 
 
 		 609 aa  318  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.296009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  38.15 
 
 		 587 aa  318  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0462  ABC transporter related  38.03 
 
 		 621 aa  317  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0731  hypothetical protein  31.86 
 
 		 582 aa  317  3e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  35.35 
 
 		 591 aa  317  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  34.83 
 
 		 620 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  34.83 
 
 		 620 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  34.83 
 
 		 620 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2299  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  37.63 
 
 		 620 aa  317  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  38.08 
 
 		 609 aa  317  5e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1419  ABC transporter related  38.08 
 
 		 609 aa  317  6e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00302849  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  38.08 
 
 		 609 aa  316  7e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  38.84 
 
 		 613 aa  316  8e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  36.39 
 
 		 589 aa  316  9e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  36.17 
 
 		 619 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  37.6 
 
 		 624 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  38.09 
 
 		 622 aa  314  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0327  ABC transporter, transmembrane region  36.73 
 
 		 587 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1621  ABC transporter related  39.51 
 
 		 618 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0907741  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  35.73 
 
 		 617 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>