More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16440 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  100 
 
 
298 aa  624  1e-178  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21290  proline-specific peptidase  89.6 
 
 
298 aa  550  1e-155  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11350  proline-specific peptidase  56.86 
 
 
295 aa  342  5.999999999999999e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24200  proline-specific peptidase  57.72 
 
 
316 aa  328  8e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  36.7 
 
 
300 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  35.93 
 
 
300 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  35.55 
 
 
307 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  36.45 
 
 
316 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  32.89 
 
 
306 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  30.87 
 
 
319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  33.33 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  33.45 
 
 
297 aa  162  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  31.62 
 
 
300 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  31.89 
 
 
299 aa  159  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  29.49 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  31.97 
 
 
292 aa  149  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  30.03 
 
 
286 aa  142  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  28.76 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  30.99 
 
 
297 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  30.1 
 
 
304 aa  130  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  28.57 
 
 
303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  27.76 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  27.59 
 
 
296 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  27.24 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1984  proline-specific peptidase  27.02 
 
 
339 aa  112  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  28.79 
 
 
287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  27.84 
 
 
320 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3362  proline-specific peptidase  26.96 
 
 
346 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158182 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  27.7 
 
 
303 aa  102  7e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0261  proline-specific peptidase  27.7 
 
 
348 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0052  prolyl aminopeptidase  26.94 
 
 
304 aa  96.7  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.946601  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  27.5 
 
 
323 aa  95.9  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  26.67 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  25.68 
 
 
369 aa  92.4  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1064  tricorn interacting factor F1  23.89 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40124  predicted protein  29.61 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.277877  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  22.92 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0830  proline-specific peptidase  27.43 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.269781  unclonable  0.00000881628 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  23.29 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 
300 aa  67  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1807  hypothetical protein  37.5 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  23.19 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1808  hypothetical protein  36.54 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  26.95 
 
 
256 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03961  proline iminopeptidase  37.3 
 
 
313 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  26.84 
 
 
429 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  26.84 
 
 
429 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  26.84 
 
 
429 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  26.84 
 
 
312 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  26.84 
 
 
312 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  21.58 
 
 
286 aa  62.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  26.84 
 
 
312 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  25.17 
 
 
278 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  25.17 
 
 
278 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  25.17 
 
 
278 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  25.17 
 
 
278 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  20.8 
 
 
294 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  26.95 
 
 
256 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  26.95 
 
 
256 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  26.47 
 
 
436 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
273 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  32.56 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2193  proline iminopeptidase  25 
 
 
414 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  23.68 
 
 
256 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  22.99 
 
 
287 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  20.5 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  21.66 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  22.58 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  28.97 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  24.16 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  24.87 
 
 
284 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03901  proline iminopeptidase  35.66 
 
 
316 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  19.78 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  31.67 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  30 
 
 
318 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  30.37 
 
 
317 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0717  proline iminopeptidase  36.44 
 
 
320 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.922147  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8864  Prolyl aminopeptidase  22.65 
 
 
319 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2056  proline iminopeptidase  24.68 
 
 
324 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03911  proline iminopeptidase  35.66 
 
 
316 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480314  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  20.36 
 
 
294 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
283 aa  60.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 
269 aa  60.5  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0360  proline iminopeptidase  24.48 
 
 
316 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03529  proline iminopeptidase  28.04 
 
 
325 aa  60.1  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  22.58 
 
 
291 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 
289 aa  60.1  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4246  alpha/beta fold family hydrolase  20.36 
 
 
294 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000956714  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  29.63 
 
 
318 aa  59.7  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4084  alpha/beta fold family hydrolase  20.36 
 
 
294 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000349067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4429  hydrolase, alpha/beta fold family  20.36 
 
 
294 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  25.31 
 
 
268 aa  59.7  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  22.22 
 
 
291 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  20.36 
 
 
294 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 
277 aa  59.7  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4577  alpha/beta fold family hydrolase  20.44 
 
 
287 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  33.05 
 
 
320 aa  59.3  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 
256 aa  58.9  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>