More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16370 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  54.32 
 
 
634 aa  659    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0627  threonyl-tRNA synthetase  75.43 
 
 
588 aa  948    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  56.74 
 
 
634 aa  665    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  56.56 
 
 
635 aa  669    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  59.22 
 
 
635 aa  702    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 
635 aa  642    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  56.21 
 
 
584 aa  671    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 
633 aa  640    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1319  hypothetical protein  62.74 
 
 
586 aa  809    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16370  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  100 
 
 
586 aa  1217    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.12349 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 
635 aa  655    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04450  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  78.84 
 
 
586 aa  988    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0386598  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 
635 aa  651    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 
639 aa  668    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  54 
 
 
640 aa  633  1e-180  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 
640 aa  628  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  52 
 
 
640 aa  626  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 
639 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 
639 aa  625  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 
639 aa  625  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 
639 aa  625  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 
639 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 
639 aa  625  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  52 
 
 
640 aa  626  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
637 aa  624  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
634 aa  621  1e-177  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
631 aa  621  1e-176  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
640 aa  618  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
639 aa  621  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 
638 aa  611  1e-173  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 
636 aa  611  1e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 
643 aa  607  9.999999999999999e-173  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  51.15 
 
 
633 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  50.88 
 
 
640 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 
640 aa  600  1e-170  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 
637 aa  593  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 
636 aa  588  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 
645 aa  585  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 
644 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 
638 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 
644 aa  581  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
645 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
642 aa  571  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 
636 aa  566  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 
646 aa  566  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
643 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0028  threonyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
603 aa  562  1.0000000000000001e-159  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
640 aa  564  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
647 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
636 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 
644 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 
636 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3623  threonyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 
643 aa  560  1e-158  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 
636 aa  558  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
638 aa  556  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 
644 aa  556  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 
635 aa  558  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 
644 aa  555  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 
641 aa  552  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
635 aa  550  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 
635 aa  549  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
640 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
640 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 
643 aa  548  1e-154  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 
638 aa  545  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 
652 aa  548  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  46.23 
 
 
638 aa  545  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
635 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
644 aa  545  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 
636 aa  545  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
635 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 
644 aa  545  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06531  threonyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
640 aa  548  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 
644 aa  545  1e-154  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 
644 aa  545  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0870  threonyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
635 aa  543  1e-153  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0199  threonyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 
602 aa  543  1e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 
637 aa  543  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
637 aa  544  1e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02079  threonyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
642 aa  542  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
640 aa  544  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 
635 aa  545  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 
637 aa  543  1e-153  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
643 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0238  threonyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
602 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 
635 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 
635 aa  538  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 
640 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0033  threonyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 
641 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.611945  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 
649 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0216  threonyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
602 aa  539  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
644 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
641 aa  541  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10531  threonyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 
638 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487806  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
645 aa  536  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
645 aa  538  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
645 aa  538  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2263  threonyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
642 aa  537  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
645 aa  538  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
648 aa  538  1e-151  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>