More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16350 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_16350  Undecaprenyl-diphosphatase  100 
 
 
314 aa  623  1e-177  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0173909 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10180  Undecaprenyl-diphosphatase  70.29 
 
 
302 aa  429  1e-119  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00316113  normal  0.0119767 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0945  Undecaprenyl-diphosphatase  70.65 
 
 
311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130471  hitchhiker  0.000579984 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0381  Undecaprenyl-diphosphatase  51.44 
 
 
310 aa  321  9.999999999999999e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.100133  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0873  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.48 
 
 
278 aa  297  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528066  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0215  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.12 
 
 
284 aa  297  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00007225  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2305  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.37 
 
 
272 aa  295  6e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.855528  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.47 
 
 
284 aa  284  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000583007  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2758  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.68 
 
 
273 aa  278  6e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000523716  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0138  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.83 
 
 
279 aa  270  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.411469  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0848  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.61 
 
 
278 aa  247  1e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0133  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.98 
 
 
293 aa  237  2e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.43082  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0234  undecaprenol kinase  39.33 
 
 
293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1407  undecaprenol kinase  38.18 
 
 
268 aa  228  1e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4087  undecaprenol kinase  41.18 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0278753  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3618  undecaprenol kinase  39.81 
 
 
266 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.359359 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  41.27 
 
 
273 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.27 
 
 
293 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.52 
 
 
293 aa  191  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  38.11 
 
 
266 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.53 
 
 
274 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1147  Bacitracin resistance protein BacA  37.86 
 
 
281 aa  186  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000333302  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.33 
 
 
275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.87 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.76 
 
 
293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.95 
 
 
293 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0610  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.24 
 
 
293 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00505052  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1204  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.58 
 
 
304 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0750612  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0198  undecaprenol kinase, putative  38.38 
 
 
267 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0237  undecaprenol kinase, putative  38.38 
 
 
267 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.8 
 
 
274 aa  179  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0541  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.57 
 
 
283 aa  178  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0858873  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1390  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.58 
 
 
304 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.7 
 
 
277 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  37.29 
 
 
269 aa  176  6e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0215  putative undecaprenol kinase  37.63 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.91 
 
 
276 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.7 
 
 
276 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.59 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.69 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.67 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  37.58 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39 
 
 
274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.03 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.42 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.76 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1046  undecaprenyl-diphosphatase  36.84 
 
 
285 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.500366  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.42 
 
 
277 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.53 
 
 
274 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23354  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.42 
 
 
276 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.33 
 
 
274 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.54 
 
 
274 aa  172  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0569  putative undecaprenol kinase  36.08 
 
 
265 aa  172  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.42 
 
 
276 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  35.29 
 
 
268 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1408  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.33 
 
 
269 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703456  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.95 
 
 
274 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.33 
 
 
277 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0437  putative undecaprenol kinase  37.04 
 
 
258 aa  170  2e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.222159  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.53 
 
 
277 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.29 
 
 
280 aa  168  8e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1235  undecaprenol kinase, putative  37.01 
 
 
258 aa  169  8e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1245  undecaprenol kinase  37.25 
 
 
258 aa  168  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.87 
 
 
276 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.87 
 
 
276 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.87 
 
 
276 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  35.22 
 
 
274 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.54 
 
 
276 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0186  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.58 
 
 
273 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.88 
 
 
276 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39 
 
 
278 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1983  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.97 
 
 
280 aa  166  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554985  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  35.86 
 
 
276 aa  166  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1538  undecaprenol kinase, putative  36.3 
 
 
280 aa  166  6.9999999999999995e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.634552 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2184  Undecaprenyl-diphosphatase  34.42 
 
 
269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36 
 
 
277 aa  166  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.62 
 
 
268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4294  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.58 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000020273  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2387  undecaprenol kinase  34.22 
 
 
283 aa  162  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371551  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0285  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.42 
 
 
281 aa  162  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.782685  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2664  undecaprenol kinase  34.22 
 
 
283 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0661  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.6 
 
 
268 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2344  undecaprenol kinase  35.22 
 
 
283 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373318  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2777  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.76 
 
 
268 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.21 
 
 
272 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333186  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0072  undecaprenol kinase  37.25 
 
 
256 aa  160  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1371  putative undecaprenol kinase  32.13 
 
 
255 aa  160  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0409188  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.74 
 
 
276 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0172  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.31 
 
 
268 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3568  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.09 
 
 
272 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0180564  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0788  undecaprenol kinase  33.77 
 
 
281 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.878199  normal  0.592274 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02927  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.01 
 
 
273 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00198226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0643  undecaprenol kinase  36.01 
 
 
273 aa  159  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0008288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0642  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.01 
 
 
273 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000274172  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02877  hypothetical protein  36.01 
 
 
273 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00183865  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3235  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.01 
 
 
273 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4369  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.01 
 
 
273 aa  159  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0259  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.42 
 
 
303 aa  159  6e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0027  undecaprenol kinase, putative  36.07 
 
 
268 aa  159  7e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36 
 
 
278 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>