More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16300 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
263 aa  530  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  3.4622e-05  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.39 
 
 
272 aa  262  5e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.31 
 
 
272 aa  261  7e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.54 
 
 
272 aa  261  8e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.39 
 
 
272 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.01 
 
 
272 aa  260  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.53 
 
 
265 aa  260  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.77 
 
 
272 aa  259  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.39 
 
 
272 aa  259  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.21 
 
 
276 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.21 
 
 
276 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.21 
 
 
272 aa  258  5e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.21 
 
 
272 aa  258  6e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.21 
 
 
272 aa  258  6e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.63 
 
 
272 aa  258  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.33 
 
 
269 aa  254  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.33 
 
 
269 aa  254  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.33 
 
 
269 aa  254  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.33 
 
 
269 aa  254  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.33 
 
 
269 aa  254  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.57 
 
 
269 aa  254  1e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.95 
 
 
269 aa  253  2e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.95 
 
 
269 aa  253  2e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.95 
 
 
269 aa  253  2e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.95 
 
 
269 aa  253  2e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.95 
 
 
269 aa  253  2e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  50.95 
 
 
269 aa  253  2e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.95 
 
 
269 aa  253  2e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.95 
 
 
269 aa  253  2e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.57 
 
 
269 aa  250  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3164  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.82 
 
 
260 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3132  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.22 
 
 
260 aa  241  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.64 
 
 
266 aa  237  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.25 
 
 
266 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.02 
 
 
270 aa  228  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.51 
 
 
264 aa  225  5e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.33748e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.94 
 
 
267 aa  220  2e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.31 
 
 
271 aa  214  9e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.11861e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.91 
 
 
275 aa  213  2e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.44 
 
 
272 aa  208  8e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.97 
 
 
270 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.68 
 
 
264 aa  201  1e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.73 
 
 
270 aa  198  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  8.1741e-08  unclonable  1.52537e-07 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0968  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.79 
 
 
271 aa  194  9e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.35 
 
 
269 aa  194  9e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0752  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.61 
 
 
303 aa  191  7e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.212702  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.92 
 
 
276 aa  191  8e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.69 
 
 
273 aa  191  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.47 
 
 
270 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  1.96708e-07 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3154  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.43 
 
 
154 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.369849 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 
274 aa  188  6e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 
266 aa  188  6e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.84 
 
 
272 aa  187  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2105  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.11 
 
 
154 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 
274 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 
271 aa  187  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  1.64624e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2889  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.48 
 
 
263 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.792584  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 
274 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.44 
 
 
270 aa  186  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.15 
 
 
263 aa  186  4e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.79105e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.12 
 
 
274 aa  185  7e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.37 
 
 
279 aa  183  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.45 
 
 
272 aa  182  4e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.45 
 
 
271 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.26 
 
 
270 aa  181  9e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.98 
 
 
262 aa  180  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 
270 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23950  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.38 
 
 
275 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.264409  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.26 
 
 
272 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  1.15496e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.16 
 
 
267 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
269 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.88 
 
 
272 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.16 
 
 
267 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.54 
 
 
264 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 
281 aa  176  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.08 
 
 
264 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2285  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.7 
 
 
266 aa  175  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.7 
 
 
264 aa  175  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.4 
 
 
257 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.98 
 
 
270 aa  174  1e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.55 
 
 
267 aa  174  2e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.4 
 
 
267 aa  171  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  36.98 
 
 
289 aa  171  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.26 
 
 
271 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  4.86618e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.43 
 
 
272 aa  169  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.6 
 
 
280 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0173  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.88 
 
 
256 aa  167  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0563052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.26 
 
 
272 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.5 
 
 
271 aa  166  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.33 
 
 
263 aa  166  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.46 
 
 
270 aa  165  6e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.64 
 
 
267 aa  165  6e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.09 
 
 
275 aa  165  7e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.65 
 
 
282 aa  164  1e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2991  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.01 
 
 
143 aa  164  2e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.44161e-13 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2914  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.4 
 
 
265 aa  163  2e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.17 
 
 
264 aa  162  5e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13156  predicted protein  37.8 
 
 
276 aa  161  9e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37833  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.02 
 
 
276 aa  161  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  35.63 
 
 
264 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>