More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16290 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_16290  universal stress protein UspA-like protein  100 
 
 
148 aa  308  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  1.27865e-05  hitchhiker  3.72029e-05 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  37.82 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  31.41 
 
 
153 aa  80.9  6e-15  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3008  UspA domain protein  35 
 
 
161 aa  80.1  1e-14  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.396305 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14760  universal stress protein UspA-like protein  33.74 
 
 
160 aa  79  2e-14  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0107987 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
138 aa  75.1  3e-13  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01240  universal stress protein UspA-like protein  32.03 
 
 
144 aa  71.6  4e-12  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  33.55 
 
 
142 aa  70.5  7e-12  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  30.34 
 
 
154 aa  70.1  9e-12  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  28.57 
 
 
180 aa  69.7  1e-11  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  31.79 
 
 
155 aa  69.3  2e-11  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.48 
 
 
143 aa  68.9  2e-11  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  28.21 
 
 
156 aa  67.4  6e-11  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
141 aa  67  9e-11  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  36.36 
 
 
140 aa  66.2  1e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  29.49 
 
 
156 aa  65.5  2e-10  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  26.54 
 
 
139 aa  65.5  2e-10  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  34 
 
 
150 aa  65.1  3e-10  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1524  UspA domain protein  32.03 
 
 
143 aa  64.7  4e-10  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0456308  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
145 aa  64.3  5e-10  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
128 aa  64.7  5e-10  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  28.28 
 
 
154 aa  63.9  8e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  29.73 
 
 
135 aa  63.9  8e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.05 
 
 
288 aa  63.5  1e-09  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 
145 aa  63.2  1e-09  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  29.3 
 
 
158 aa  63.2  1e-09  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  29.52 
 
 
169 aa  62.4  2e-09  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 
140 aa  62.4  2e-09  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0087  UspA domain protein  26.32 
 
 
137 aa  62.4  2e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.270919 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 
145 aa  62.4  2e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0090  UspA domain protein  27.21 
 
 
137 aa  62.4  2e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2861  UspA domain protein  26.71 
 
 
134 aa  62  3e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.569855  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  28.48 
 
 
151 aa  61.6  4e-09  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2768  UspA domain protein  27.89 
 
 
134 aa  60.8  5e-09  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.327579  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  32.92 
 
 
151 aa  60.5  7e-09  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  30.14 
 
 
140 aa  60.5  8e-09  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 
140 aa  59.7  1e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4276  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 
135 aa  59.7  1e-08  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  29.61 
 
 
147 aa  59.7  1e-08  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.35 
 
 
143 aa  59.7  1e-08  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  27.45 
 
 
207 aa  60.1  1e-08  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  29.68 
 
 
141 aa  58.9  2e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 
297 aa  58.9  2e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  30.87 
 
 
152 aa  59.3  2e-08  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2675  universal stress protein UspA  26.03 
 
 
134 aa  59.3  2e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2020  UspA domain protein  32.92 
 
 
165 aa  59.3  2e-08  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  4.26305e-12 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  32 
 
 
152 aa  58.9  3e-08  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1585  UspA domain protein  27.21 
 
 
137 aa  58.5  3e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0149125 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  27.89 
 
 
283 aa  58.5  3e-08  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.75107e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  32.03 
 
 
307 aa  58.5  3e-08  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  32.43 
 
 
145 aa  58.2  3e-08  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0923  UspA domain protein  31.08 
 
 
130 aa  58.5  3e-08  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.840316  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  32 
 
 
144 aa  58.2  4e-08  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 
144 aa  57.8  5e-08  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  30.87 
 
 
137 aa  57.4  7e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 
153 aa  57  8e-08  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 
141 aa  57  8e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  28 
 
 
145 aa  57  9e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  28.08 
 
 
144 aa  56.6  1e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  26.17 
 
 
140 aa  56.6  1e-07  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  28.76 
 
 
159 aa  56.2  1e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  26.67 
 
 
140 aa  56.2  2e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.77 
 
 
164 aa  55.8  2e-07  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  3.19103e-10  hitchhiker  1.2302e-09 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  26.17 
 
 
140 aa  55.5  2e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  28.3 
 
 
151 aa  55.5  2e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  26.67 
 
 
140 aa  56.2  2e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  29.3 
 
 
290 aa  55.5  2e-07  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  27.33 
 
 
140 aa  55.8  2e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  28.95 
 
 
147 aa  55.8  2e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  26.67 
 
 
140 aa  56.2  2e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  26.67 
 
 
140 aa  56.2  2e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.86 
 
 
147 aa  55.8  2e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  26.67 
 
 
140 aa  56.2  2e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  27.33 
 
 
140 aa  55.8  2e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.1295e-05  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4503  hypothetical protein  28.86 
 
 
280 aa  55.8  2e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 
138 aa  55.1  3e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  27.33 
 
 
145 aa  55.1  3e-07  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  26.67 
 
 
140 aa  55.5  3e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 
142 aa  55.5  3e-07  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.33 
 
 
142 aa  54.7  4e-07  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  25.33 
 
 
153 aa  54.7  4e-07  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  25.17 
 
 
294 aa  54.7  4e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  27.03 
 
 
150 aa  54.3  6e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  27.45 
 
 
304 aa  54.3  6e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  27.33 
 
 
145 aa  54.3  6e-07  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  27.03 
 
 
138 aa  54.3  6e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  29.05 
 
 
147 aa  53.9  6e-07  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  29.45 
 
 
140 aa  53.9  7e-07  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  30.28 
 
 
145 aa  53.5  8e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  29.01 
 
 
157 aa  53.9  8e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 
128 aa  53.9  8e-07  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  29.01 
 
 
157 aa  53.9  8e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 
137 aa  53.5  9e-07  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  27.67 
 
 
140 aa  53.5  9e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  31.37 
 
 
167 aa  53.5  9e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  27.78 
 
 
141 aa  53.5  9e-07  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.61 
 
 
162 aa  53.5  1e-06  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  29.53 
 
 
145 aa  53.1  1e-06  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  29.17 
 
 
138 aa  53.5  1e-06  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1332  hypothetical protein  26.03 
 
 
145 aa  53.1  1e-06  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  1.72519e-06 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>