More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16290 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_16290  universal stress protein UspA-like protein  100 
 
 		 148 aa  308  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000127865  hitchhiker  0.0000372029 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  37.82 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  31.41 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3008  UspA domain protein  35 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.396305 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14760  universal stress protein UspA-like protein  33.74 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0107987 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01240  universal stress protein UspA-like protein  32.03 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  33.55 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  30.34 
 
 		 154 aa  70.1  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  28.57 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.48 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  31.79 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  28.21 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  36.36 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  29.49 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  26.54 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  34 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1524  UspA domain protein  32.03 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0456308  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  29.73 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  28.28 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  29.3 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.05 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  29.52 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0090  UspA domain protein  27.21 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0087  UspA domain protein  26.32 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.270919 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2861  UspA domain protein  26.71 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.569855  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  28.48 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2768  UspA domain protein  27.89 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.327579  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  32.92 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  30.14 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  29.61 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.35 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  27.45 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4276  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  29.68 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  30.87 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2675  universal stress protein UspA  26.03 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2020  UspA domain protein  32.92 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000426305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0923  UspA domain protein  31.08 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.840316  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  32.43 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  32.03 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  32 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1585  UspA domain protein  27.21 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0149125 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  27.89 
 
 		 283 aa  58.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  32 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  30.87 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  28.76 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  26.17 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  28.08 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  27.33 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  26.67 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  26.17 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  26.67 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  26.67 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.86 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  28.3 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  26.67 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  28.95 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  29.3 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4503  hypothetical protein  28.86 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  27.33 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  26.67 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  27.33 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  26.67 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  25.33 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  25.17 
 
 		 294 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.33 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  29.05 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  27.03 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  27.03 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  27.45 
 
 		 304 aa  54.3  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  27.33 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  29.45 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  29.01 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  29.01 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  30.28 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  31.37 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  27.67 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  27.78 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  29.53 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  29.14 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  26.17 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  30.2 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>