More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16280 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_16280  SSU ribosomal protein S12P  100 
 
 		 123 aa  247  5e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000991521  hitchhiker  0.0000080182 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  91.06 
 
 		 124 aa  228  3e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  89.43 
 
 		 123 aa  224  4e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 124 aa  203  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 124 aa  202  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  202  2e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  200  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3469  ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  199  9e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329977  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5078  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  199  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.621439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1279  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  199  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  199  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  79.67 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 135 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  197  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4326  ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 139 aa  197  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  197  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23900  SSU ribosomal protein S12P  78.05 
 
 		 124 aa  197  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  197  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1012  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0984  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1002  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3806  ribosomal protein S12  80.99 
 
 		 123 aa  197  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.800192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  79.51 
 
 		 123 aa  197  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1115  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  197  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  196  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  80.17 
 
 		 122 aa  196  7e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 135 aa  196  7e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1166  ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 142 aa  196  7.999999999999999e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000185152  unclonable  0.0000000295483 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0557  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.563691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10696  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2651  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  194  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  194  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  194  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0622  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  194  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1081  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  194  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0921  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  194  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0208  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  193  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000137299  unclonable  0.00000763444 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4465  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  192  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0191  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  192  9e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00539976  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4061  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  192  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000816625  hitchhiker  0.00000101857 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0195  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  192  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00503179  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2771  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000785263  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0226  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00057  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002297  SSU ribosomal protein S12p (S23e)  78.05 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000970736  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0194  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0259871  hitchhiker  0.00000480785 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0189  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.019095  decreased coverage  0.000333311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  191  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 125 aa  192  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17230  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4320  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3148  ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3928  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.418026  normal  0.366347 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 128 aa  191  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0194  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00424917  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3764  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000216882  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4767  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  191  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0523038  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 137 aa  191  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2695  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  191  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.281072 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2160  30S ribosomal protein S12  75.21 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174142  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5119  ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2982  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  191  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80538  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1833  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 202 aa  191  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0567288  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4322  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00668981  unclonable  0.000000000093676 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0981  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  191  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.808535  normal  0.0659851 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0179  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00020988  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 134 aa  191  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  191  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4695  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00310742  unclonable  0.0000000329491 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 123 aa  191  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  191  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2014  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 123 aa  191  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 123 aa  191  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3166  30S ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 137 aa  191  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.935823 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 125 aa  191  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 129 aa  190  5e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  190  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 126 aa  190  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 126 aa  190  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 126 aa  190  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 126 aa  190  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20930  SSU ribosomal protein S12P  78.05 
 
 		 124 aa  190  6e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.6321  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0371  ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  190  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.72822e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0371  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  190  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000085622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3716  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  190  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000501374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3623  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  190  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000437781  hitchhiker  0.00102152 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3816  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  190  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000929578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3811  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  190  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000707874  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 126 aa  189  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0165  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  190  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000589821  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3538  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  190  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.3416399999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03144  hypothetical protein  75.61 
 
 		 124 aa  190  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000164791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>