115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16170 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_16170  uncharacterized PSP1-like protein  100 
 
 
500 aa  1035  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  2.03324e-08 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1147  PSP1 domain protein  57.73 
 
 
526 aa  379  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.233245  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09190  uncharacterized PSP1-like protein  55.86 
 
 
443 aa  369  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.221137 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1090  PSP1 domain protein  39.3 
 
 
517 aa  320  3e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.220883  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0039  PSP1 domain protein  51.56 
 
 
302 aa  252  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0057  PSP1 domain-containing protein  50.2 
 
 
293 aa  250  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0061  PSP1 domain-containing protein  47.01 
 
 
282 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2104  PSP1  49.2 
 
 
291 aa  245  1e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  5.20561e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0160  PSP1 domain protein  47.6 
 
 
291 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.100809  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0028  PSP1 domain protein  47.29 
 
 
275 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20350  PSP1 domain protein  44.4 
 
 
288 aa  235  1e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0037  hypothetical protein  46.12 
 
 
275 aa  233  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5279  hypothetical protein  46.12 
 
 
275 aa  233  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0037  hypothetical protein  46.12 
 
 
275 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0041  hypothetical protein  46.12 
 
 
275 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0027  PSP1 domain-containing protein  46.12 
 
 
275 aa  233  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0026  PSP1 domain protein  49.6 
 
 
275 aa  233  7e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2443  PSP1 domain-containing protein  48.61 
 
 
301 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0516  PSP1 domain protein  47.24 
 
 
295 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0840264  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0038  PSP1 domain-containing protein  48.98 
 
 
270 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.214386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0027  PSP1 domain-containing protein  45.74 
 
 
275 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0031  hypothetical protein  45.74 
 
 
278 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0029  hypothetical protein  45.74 
 
 
278 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0028  signal peptidase-like protein  45.74 
 
 
278 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0028  signal peptidase-like protein  45.74 
 
 
278 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.356586  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0030  hypothetical protein  45.74 
 
 
278 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2758  PSP1 domain-containing protein  48.21 
 
 
301 aa  230  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0506  PSP1 domain-containing protein  45.68 
 
 
267 aa  228  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0519  PSP1 domain-containing protein  45.68 
 
 
267 aa  228  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.34633  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1948  PSP1 domain protein  41.94 
 
 
364 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.640853  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0123  hypothetical protein  44.44 
 
 
267 aa  224  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0102  PSP1 domain protein  44.85 
 
 
270 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0883281  unclonable  2.41869e-10 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0124  PSP1 domain protein  52.53 
 
 
219 aa  224  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00134499  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0536  hypothetical protein  42.59 
 
 
277 aa  220  4e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1593  hypothetical protein  41.37 
 
 
374 aa  220  4e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.571552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1909  PSP1 domain protein  44.8 
 
 
410 aa  219  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308511  normal  0.225055 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1057  PSP1 domain protein  41.43 
 
 
312 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16958e-14 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3206  PSP1 domain protein  41.43 
 
 
312 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0232382  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_477  PSP1-like protein  42.22 
 
 
277 aa  218  3e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1693  PSP-like protein  41.2 
 
 
366 aa  216  6e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.54469e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2320  PSP1  41.92 
 
 
348 aa  216  6e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.20089  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2231  hypothetical protein  42.31 
 
 
345 aa  216  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1076  PSP1 domain-containing protein  44.57 
 
 
508 aa  215  2e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0512  PSP1 domain-containing protein  42.12 
 
 
277 aa  215  2e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1663  PSP1 domain-containing protein  40.74 
 
 
362 aa  214  3e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0062  PSP1 domain protein  50.23 
 
 
282 aa  214  3e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0293146  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3205  PSP1 domain-containing protein  41.01 
 
 
284 aa  211  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3155  PSP1 domain-containing protein  40.41 
 
 
315 aa  210  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00192464  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1637  PSP1 domain-containing protein  46.54 
 
 
406 aa  209  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.293382  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0044  Signal peptidase II  45.26 
 
 
239 aa  208  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.494362  hitchhiker  9.21267e-05 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3465  PSP1 domain-containing protein  43.54 
 
 
379 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2254  PSP1 domain-containing protein  47.24 
 
 
406 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0152861 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0155  PSP1 domain-containing protein  42.21 
 
 
265 aa  207  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0760  PSP1 domain protein  39.23 
 
 
558 aa  206  8e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0314  PSP1 domain protein  39.92 
 
 
384 aa  206  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0043  hypothetical protein  48.37 
 
 
238 aa  204  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000138345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2118  PSP1 domain protein  48.84 
 
 
228 aa  204  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.76409e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3912  PSP1 domain-containing protein  42.59 
 
 
300 aa  203  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1170  PSP1 domain-containing protein  37.79 
 
 
487 aa  201  4e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.475432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3183  PSP1 domain protein  39.42 
 
 
423 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4539  PSP1 domain protein  41.82 
 
 
275 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2937  PSP1 domain protein  39.25 
 
 
302 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1421  PSP1 domain protein  41.92 
 
 
362 aa  192  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.703416  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9214  signal peptidase-like protein  40 
 
 
283 aa  186  1e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0305  PSP1 domain-containing protein  39.11 
 
 
345 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.782798  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1125  PSP1 domain protein  40.82 
 
 
266 aa  183  6e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  7.05514e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8391  PSP1 domain protein  41.63 
 
 
284 aa  180  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1964  PSP1 domain-containing protein  40.23 
 
 
277 aa  179  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71417  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0790  PSP1 domain protein  39.76 
 
 
300 aa  179  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4399  PSP1 domain-containing protein  39.13 
 
 
277 aa  177  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1868  PSP1 domain-containing protein  39.44 
 
 
520 aa  177  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605977  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6482  PSP1 domain protein  41.03 
 
 
646 aa  177  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0745  PSP1 domain protein  33.21 
 
 
276 aa  176  1e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4018  PSP1 domain-containing protein  37.91 
 
 
277 aa  175  2e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.670242 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4308  PSP1  35.74 
 
 
315 aa  172  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0080  PSP1 domain protein  41.36 
 
 
324 aa  172  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.918757  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0410  PSP1 domain-containing protein  35.9 
 
 
298 aa  169  8e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1490  PSP1 domain-containing protein  35.71 
 
 
294 aa  169  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1944  PSP1 domain-containing protein  35.74 
 
 
278 aa  166  1e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0237461  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0113  tpl protein  44.83 
 
 
304 aa  166  1e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2253  PSP1 domain protein  39.41 
 
 
321 aa  166  1e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0528  signaling phosphorelay regulator protein  35.46 
 
 
268 aa  166  1e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0038  PSP1 domain protein  40.98 
 
 
328 aa  164  4e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0154  PSP1 domain-containing protein  38.3 
 
 
271 aa  162  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0156  PSP1 domain-containing protein  38.3 
 
 
271 aa  161  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000326451  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1017  PSP1 domain protein  34.07 
 
 
404 aa  160  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0292  hypothetical protein  32.92 
 
 
514 aa  159  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0400  hypothetical protein  33 
 
 
427 aa  159  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3600  PSP1 domain protein  32.58 
 
 
508 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0447  signaling phosphorelay regulator protein  40.09 
 
 
260 aa  156  7e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5965  PSP1 domain protein  36.09 
 
 
398 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.565053 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03465  hypothetical protein  33.01 
 
 
390 aa  147  4e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1476  PSP1 domain protein  36.7 
 
 
462 aa  143  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.71704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0874  PSP1 domain protein  35.71 
 
 
490 aa  140  4e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0231  PSP1  33.21 
 
 
279 aa  137  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0402  PSP1 domain protein  31.02 
 
 
290 aa  137  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0891  PSP1 domain-containing protein  38.6 
 
 
456 aa  136  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0076  PSP1 domain protein  40.38 
 
 
463 aa  130  8e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2781  hypothetical protein  37.56 
 
 
268 aa  128  2e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1762  PSP1 domain-containing protein  30.63 
 
 
259 aa  124  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>