More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_15260 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_15260  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  100 
 
 
194 aa  393  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.802497  normal  0.249652 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1081  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  65.46 
 
 
197 aa  260  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000121511 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1003  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.37 
 
 
194 aa  248  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0921  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.97 
 
 
195 aa  245  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0124066  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  244  8e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2353  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.59 
 
 
196 aa  241  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11788  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1883  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.51 
 
 
195 aa  241  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.49 
 
 
195 aa  241  5e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.805329 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.07 
 
 
195 aa  241  6e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.008915  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  237  6.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2788  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  236  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.391229  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2784  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.96 
 
 
196 aa  235  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.76 
 
 
206 aa  232  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0838  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
202 aa  231  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.41 
 
 
195 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3597  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.44 
 
 
199 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3493  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
202 aa  231  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2081  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
202 aa  230  8.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2001  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
202 aa  230  8.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.49434  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.49 
 
 
195 aa  230  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.228917  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2554  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.41 
 
 
197 aa  229  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0400  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  229  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2771  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.38 
 
 
195 aa  229  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259514  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2548  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.38 
 
 
195 aa  229  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0108  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  228  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.926859 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0698  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.25 
 
 
206 aa  228  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0467  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.87 
 
 
195 aa  228  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0345  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  226  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0354  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  226  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.332869 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4056  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.48 
 
 
195 aa  226  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.738994  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0406  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  225  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.186972 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3525  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  225  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0386  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.96 
 
 
195 aa  225  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2478  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.36 
 
 
195 aa  225  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0104295 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2680  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  225  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0427  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  225  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3691  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.41 
 
 
195 aa  224  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0247  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.9 
 
 
201 aa  225  4e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2034  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.89 
 
 
196 aa  225  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0330  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  225  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.843047  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7533  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.41 
 
 
200 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1619  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.76 
 
 
198 aa  224  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3558  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.92 
 
 
195 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.451024  hitchhiker  0.0000499164 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3040  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.03 
 
 
195 aa  224  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000415747  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4308  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
202 aa  224  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3722  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.41 
 
 
195 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2712  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.41 
 
 
195 aa  224  7e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3664  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.41 
 
 
195 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2763  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.41 
 
 
195 aa  224  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1790  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.41 
 
 
195 aa  224  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3241  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.41 
 
 
195 aa  224  7e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
236 aa  224  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.92 
 
 
200 aa  223  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2757  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.41 
 
 
195 aa  223  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2991  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.92 
 
 
195 aa  223  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.922972  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3981  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
202 aa  223  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0833  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
199 aa  223  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0326052  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2938  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
198 aa  223  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3098  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.96 
 
 
195 aa  223  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2950  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
196 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3227  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
196 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2880  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
196 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0502764 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2717  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.31 
 
 
195 aa  221  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2028  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.38 
 
 
213 aa  221  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476517  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0429  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
207 aa  221  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.554154 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1063  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
198 aa  221  7e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.179926  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.44 
 
 
195 aa  221  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3263  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
202 aa  221  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0754  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.96 
 
 
196 aa  220  8e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3703  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.48 
 
 
195 aa  221  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0148  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.36 
 
 
197 aa  220  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3798  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.48 
 
 
195 aa  220  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1460  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
194 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.92 
 
 
195 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0825  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.51 
 
 
195 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00384166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.9 
 
 
195 aa  220  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2687  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.44 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1203  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0314  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03041  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.77 
 
 
201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2978  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
195 aa  218  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00102167  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1494  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
194 aa  219  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0283  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
201 aa  218  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603914  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0487  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3413  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.44 
 
 
199 aa  218  5e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.901553  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0220  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
202 aa  218  6e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0251  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.33 
 
 
198 aa  218  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000155006  normal  0.0277595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04590  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
197 aa  218  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3077  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56 
 
 
208 aa  217  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2958  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.73 
 
 
204 aa  217  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.194026  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3285  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
209 aa  217  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
198 aa  217  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3061  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56 
 
 
208 aa  217  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3120  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56 
 
 
208 aa  217  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1168  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
202 aa  217  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03051  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.79 
 
 
201 aa  216  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.299371  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5045  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
196 aa  216  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3149  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.79 
 
 
195 aa  217  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5879  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.971219  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0125  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
209 aa  215  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>