49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14900 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  496  1e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  67.08 
 
 
241 aa  348  4e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  2.80748e-05  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  54.39 
 
 
239 aa  257  1e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  50.64 
 
 
231 aa  248  5e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  48.74 
 
 
232 aa  237  1e-61  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  49.79 
 
 
234 aa  236  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  53.14 
 
 
235 aa  232  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  46.44 
 
 
234 aa  232  4e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  42.13 
 
 
241 aa  207  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  35.21 
 
 
228 aa  119  4e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  40.26 
 
 
228 aa  117  1e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  40.26 
 
 
228 aa  117  2e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  40.26 
 
 
228 aa  116  4e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  40.26 
 
 
228 aa  116  4e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  35.57 
 
 
228 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  38.85 
 
 
239 aa  110  2e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  33.51 
 
 
242 aa  108  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  30.97 
 
 
236 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  39.33 
 
 
228 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  36.65 
 
 
239 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  41.22 
 
 
227 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  35.37 
 
 
235 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  29.13 
 
 
233 aa  96.3  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  32.98 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  31.72 
 
 
240 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  27.95 
 
 
235 aa  86.3  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.25396e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  35.11 
 
 
218 aa  79.3  5e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  33.33 
 
 
221 aa  77.4  2e-13  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  26.23 
 
 
249 aa  73.2  3e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  30.95 
 
 
224 aa  68.2  1e-10  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  25.64 
 
 
238 aa  66.6  3e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  25 
 
 
230 aa  66.6  3e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  22.95 
 
 
234 aa  65.9  5e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  29.69 
 
 
221 aa  65.9  6e-10  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  25.65 
 
 
241 aa  65.1  8e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  29.57 
 
 
221 aa  64.7  1e-09  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  25.33 
 
 
236 aa  64.7  1e-09  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  27.78 
 
 
221 aa  64.3  2e-09  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  24.87 
 
 
230 aa  60.1  3e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  27.14 
 
 
238 aa  57.4  2e-07  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  21.52 
 
 
230 aa  56.2  4e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  22.43 
 
 
230 aa  51.6  1e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  26.52 
 
 
217 aa  49.3  6e-05  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  26.61 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  27.81 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01730  hypothetical protein  25.56 
 
 
232 aa  46.2  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00581405  hitchhiker  6.34299e-09 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0925  hypothetical protein  43.86 
 
 
57 aa  45.4  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  5.09221e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  21.24 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  24.82 
 
 
220 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>