More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14740 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  58.18 
 
 		 596 aa  731    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  54.31 
 
 		 619 aa  664    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  100 
 
 		 590 aa  1228    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  56.68 
 
 		 592 aa  732    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  61.37 
 
 		 595 aa  768    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  53.16 
 
 		 589 aa  632  1e-180  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  50.43 
 
 		 611 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  37.12 
 
 		 522 aa  338  1.9999999999999998e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  34.88 
 
 		 603 aa  328  1.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2028  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase-like protein  32.41 
 
 		 300 aa  151  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194318 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  35.19 
 
 		 227 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  34.72 
 
 		 227 aa  140  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 622 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  23.75 
 
 		 622 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  28.57 
 
 		 304 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1459  LicC protein  26.58 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  25.19 
 
 		 267 aa  76.3  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  28.34 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  25.52 
 
 		 383 aa  73.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  28.34 
 
 		 314 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  28.98 
 
 		 253 aa  69.3  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  28.4 
 
 		 247 aa  67  0.0000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  25.1 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  31.34 
 
 		 262 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  39.05 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  31.63 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  30.91 
 
 		 247 aa  63.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  32.2 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  32.73 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  32 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  31.05 
 
 		 311 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03020  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  29.01 
 
 		 364 aa  59.7  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  31.43 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  32.61 
 
 		 249 aa  58.9  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  27.5 
 
 		 261 aa  59.3  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  32.26 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  32.26 
 
 		 253 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  30.59 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.43 
 
 		 355 aa  59.7  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  29.82 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  33.64 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  25 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  29.52 
 
 		 616 aa  57.8  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  30.51 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  25 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  32.48 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  28.97 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  29.73 
 
 		 234 aa  56.6  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  32.48 
 
 		 228 aa  57  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  31.96 
 
 		 222 aa  56.6  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  25.62 
 
 		 307 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  35.71 
 
 		 241 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  26.76 
 
 		 400 aa  56.2  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  29.09 
 
 		 257 aa  56.2  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  40.28 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  25.5 
 
 		 578 aa  55.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  26.96 
 
 		 254 aa  55.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  30.7 
 
 		 227 aa  56.2  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  25.54 
 
 		 393 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  31.87 
 
 		 263 aa  55.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  41.79 
 
 		 245 aa  55.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  31.86 
 
 		 384 aa  55.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  48.21 
 
 		 383 aa  55.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  30.08 
 
 		 219 aa  54.7  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  47.27 
 
 		 392 aa  54.7  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  29.75 
 
 		 243 aa  55.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  40.85 
 
 		 399 aa  54.7  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  30.08 
 
 		 219 aa  54.7  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  44.44 
 
 		 244 aa  54.7  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  30.09 
 
 		 256 aa  54.7  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  30.87 
 
 		 230 aa  54.3  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  38.46 
 
 		 253 aa  54.3  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  29.2 
 
 		 246 aa  54.3  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  37.88 
 
 		 330 aa  54.3  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  36.84 
 
 		 325 aa  54.3  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  30.09 
 
 		 854 aa  53.9  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  26.96 
 
 		 239 aa  53.9  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.17 
 
 		 400 aa  53.5  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  29.01 
 
 		 362 aa  53.5  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  30.7 
 
 		 263 aa  53.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  29.81 
 
 		 374 aa  53.5  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  28.7 
 
 		 245 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1607  Nucleotidyl transferase  30.43 
 
 		 248 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0819429  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0080  nucleotidyl transferase  49.25 
 
 		 225 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2143  putative guanyltransferase  39.34 
 
 		 240 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.187528  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  43.1 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  29.91 
 
 		 229 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  27.83 
 
 		 223 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3961  Nucleotidyl transferase  29.91 
 
 		 243 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  35.48 
 
 		 252 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  29.03 
 
 		 351 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  31.82 
 
 		 252 aa  52.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  42.47 
 
 		 230 aa  52.4  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  36.62 
 
 		 393 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  32.11 
 
 		 403 aa  53.1  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3317  Nucleotidyl transferase  34.09 
 
 		 243 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  25 
 
 		 384 aa  52.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  26.9 
 
 		 348 aa  52  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1999  nucleotidyl transferase  29.91 
 
 		 240 aa  52  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00143776  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  28.7 
 
 		 249 aa  52.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>