163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14530 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  100 
 
 		 602 aa  1233    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  35.12 
 
 		 550 aa  209  9e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 651 aa  194  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  36.93 
 
 		 573 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  35.98 
 
 		 613 aa  182  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  36.63 
 
 		 430 aa  177  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  33.61 
 
 		 552 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  43.63 
 
 		 330 aa  173  9e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 532 aa  169  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  38.97 
 
 		 807 aa  169  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  40.32 
 
 		 502 aa  166  9e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  35.16 
 
 		 753 aa  164  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 757 aa  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  32.88 
 
 		 512 aa  154  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  34.23 
 
 		 454 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  40.66 
 
 		 342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  38.67 
 
 		 324 aa  147  8.000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  33.13 
 
 		 434 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  34.07 
 
 		 2495 aa  141  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  35.89 
 
 		 891 aa  140  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  33.94 
 
 		 316 aa  138  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  38.22 
 
 		 592 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  47.37 
 
 		 478 aa  136  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  40.44 
 
 		 811 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  28.33 
 
 		 1557 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  37.5 
 
 		 331 aa  131  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  33.77 
 
 		 750 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  48.57 
 
 		 302 aa  126  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  34.63 
 
 		 377 aa  118  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  48.31 
 
 		 440 aa  117  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.61 
 
 		 762 aa  115  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  34.54 
 
 		 817 aa  114  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  42.06 
 
 		 578 aa  94.7  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  30 
 
 		 737 aa  94  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  40.62 
 
 		 465 aa  93.6  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  38.8 
 
 		 1732 aa  93.2  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  28.52 
 
 		 2821 aa  87.8  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  28.57 
 
 		 697 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  28.37 
 
 		 1527 aa  84.7  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  31.4 
 
 		 1131 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  27 
 
 		 1131 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  34.85 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  51.95 
 
 		 203 aa  78.6  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.73 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  22.3 
 
 		 589 aa  77.8  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  36.17 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  29.35 
 
 		 1514 aa  77  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 524 aa  69.7  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  38.52 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1002 aa  64.3  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1009 aa  63.9  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  25.17 
 
 		 890 aa  60.8  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  25 
 
 		 1475 aa  60.5  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1025 aa  60.5  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  26.34 
 
 		 587 aa  58.9  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  25.99 
 
 		 1363 aa  57.4  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04480  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  28.48 
 
 		 422 aa  56.2  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  34.82 
 
 		 306 aa  55.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  31.73 
 
 		 283 aa  54.7  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  29.56 
 
 		 253 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0239  NlpC/P60 family protein  30.71 
 
 		 249 aa  54.3  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3380  NLP/P60 protein  30.71 
 
 		 234 aa  53.9  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00222  predicted lipoprotein and C40 family peptidase  29.92 
 
 		 249 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  29.23 
 
 		 388 aa  53.5  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00226  hypothetical protein  29.92 
 
 		 249 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0255  NlpC/P60 family protein  29.92 
 
 		 269 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0261  NlpC/P60 family protein  29.92 
 
 		 269 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4584  NLP/P60 protein  26.92 
 
 		 276 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.26 
 
 		 549 aa  53.5  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2050  NLP/P60 protein  22.35 
 
 		 696 aa  52.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.426387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  30.47 
 
 		 371 aa  52.8  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0122  NLP/P60 protein  30.7 
 
 		 264 aa  52.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3393  NLP/P60 protein  29.92 
 
 		 208 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0223  YafL  29.92 
 
 		 249 aa  52.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0271  NlpC/P60 family protein  29.92 
 
 		 257 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.677165 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  30.7 
 
 		 270 aa  52.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  26.17 
 
 		 420 aa  52.4  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  30.89 
 
 		 535 aa  51.6  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  30.77 
 
 		 337 aa  51.6  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.62 
 
 		 556 aa  51.2  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  30.1 
 
 		 362 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  30.1 
 
 		 362 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  30.1 
 
 		 362 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  27.32 
 
 		 208 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  28.87 
 
 		 1048 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  35.65 
 
 		 345 aa  50.4  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  30.57 
 
 		 204 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0430  NLP/P60 protein  28.33 
 
 		 283 aa  50.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  31.91 
 
 		 281 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  33.63 
 
 		 317 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  26.85 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  28.15 
 
 		 388 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  26.25 
 
 		 532 aa  49.3  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  25 
 
 		 286 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  25.17 
 
 		 374 aa  48.9  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  24.39 
 
 		 286 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  24.39 
 
 		 286 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_004310  BR2179  NLP/P60 family protein  30.56 
 
 		 290 aa  48.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  28.85 
 
 		 294 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2091  NLP/P60 family protein  30.56 
 
 		 290 aa  48.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>