More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14150 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  100 
 
 
451 aa  931  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  42.96 
 
 
443 aa  343  4e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  39.36 
 
 
460 aa  308  2e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  28.79 
 
 
392 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  3.97895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  28.27 
 
 
363 aa  157  5e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  28.61 
 
 
390 aa  154  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.82 
 
 
378 aa  153  6e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  28.82 
 
 
435 aa  152  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  30.25 
 
 
414 aa  149  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.30336e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  26.46 
 
 
369 aa  149  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  25.95 
 
 
369 aa  147  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  1.20563e-05 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  29.45 
 
 
379 aa  146  7e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  27.8 
 
 
377 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  26.21 
 
 
369 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  29.9 
 
 
377 aa  143  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  27.45 
 
 
389 aa  142  1e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  28.74 
 
 
400 aa  140  4e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  25.82 
 
 
370 aa  140  4e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.51 
 
 
374 aa  140  5e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.51 
 
 
374 aa  140  5e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  27.16 
 
 
370 aa  137  3e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  27.67 
 
 
383 aa  137  3e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.32895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  28.42 
 
 
426 aa  136  1e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  27.92 
 
 
391 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  28.12 
 
 
413 aa  133  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  25.84 
 
 
373 aa  130  5e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  27.47 
 
 
477 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  27.54 
 
 
379 aa  129  1e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  27.54 
 
 
379 aa  129  1e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  26.33 
 
 
386 aa  128  2e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  27.67 
 
 
368 aa  124  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  25.95 
 
 
381 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.65595e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  25.19 
 
 
378 aa  122  9e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  28.61 
 
 
305 aa  122  1e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  29.49 
 
 
383 aa  119  8e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  29.46 
 
 
409 aa  119  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  24.82 
 
 
392 aa  119  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  26.14 
 
 
385 aa  119  1e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.19227e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  27.89 
 
 
387 aa  119  1e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  25.7 
 
 
391 aa  118  2e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  28.7 
 
 
368 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  26.09 
 
 
391 aa  115  1e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  26.08 
 
 
376 aa  114  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  24.72 
 
 
325 aa  112  1e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  27.86 
 
 
385 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  25.56 
 
 
371 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  24.88 
 
 
463 aa  107  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  25.55 
 
 
386 aa  106  7e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.48 
 
 
443 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  26.36 
 
 
387 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  25.9 
 
 
388 aa  104  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  24.82 
 
 
393 aa  103  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  24.13 
 
 
398 aa  103  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  7.33221e-05 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  25.57 
 
 
422 aa  102  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  24.62 
 
 
398 aa  101  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  24.54 
 
 
388 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  26.01 
 
 
393 aa  101  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  23.78 
 
 
367 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  24.22 
 
 
357 aa  97.1  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  24.94 
 
 
393 aa  97.1  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  29.82 
 
 
365 aa  96.7  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  25.07 
 
 
370 aa  96.7  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  24.03 
 
 
431 aa  96.7  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  24.66 
 
 
422 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  25.78 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  32.83 
 
 
393 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3743  integrase family protein  24.36 
 
 
445 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3794  integrase family protein  24.36 
 
 
445 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0397442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  32.83 
 
 
442 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  23.98 
 
 
401 aa  94.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.53 
 
 
376 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.53 
 
 
376 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  25.8 
 
 
381 aa  94  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  25.58 
 
 
404 aa  93.6  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  25.23 
 
 
487 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  25.95 
 
 
378 aa  93.2  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  23.9 
 
 
402 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  22.97 
 
 
416 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  25.36 
 
 
381 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0546  integrase family protein  22.36 
 
 
403 aa  91.7  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.849888  hitchhiker  0.000145945 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  24.05 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  24.32 
 
 
374 aa  90.5  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  22.78 
 
 
376 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.92232e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  24.11 
 
 
438 aa  89.4  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  24.3 
 
 
381 aa  88.2  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  26.77 
 
 
471 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  25.6 
 
 
370 aa  87.4  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  26.77 
 
 
471 aa  87  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  34.32 
 
 
374 aa  86.7  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  24.24 
 
 
421 aa  87  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  22.44 
 
 
404 aa  86.7  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  25.71 
 
 
506 aa  85.9  1e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  5.91844e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 
404 aa  86.3  1e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  32.57 
 
 
209 aa  85.5  2e-15  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  24.01 
 
 
429 aa  85.5  2e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  22.62 
 
 
399 aa  84.7  3e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  24.3 
 
 
395 aa  84  6e-15  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  25.96 
 
 
454 aa  83.2  9e-15  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  24.48 
 
 
416 aa  82.8  1e-14  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  21.48 
 
 
428 aa  81.6  3e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>