More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_13290 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_13290  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 318 aa  639    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  39.68 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  41.82 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  41.82 
 
 		 303 aa  228  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  42.14 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  41.82 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  41.82 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  42.14 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  42.14 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  41.82 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  42.14 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  42.14 
 
 		 303 aa  227  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0599  1-phosphofructokinase  39.62 
 
 		 338 aa  220  3e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0298214  normal  0.491276 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  40.25 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  38.68 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  37.81 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  39.87 
 
 		 303 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  40.32 
 
 		 304 aa  195  9e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  36.16 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  36.16 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  39.87 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  39.56 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  41.07 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  38.36 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  36.79 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  34.59 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  37.46 
 
 		 308 aa  176  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  35.24 
 
 		 302 aa  176  6e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  31.76 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  37.11 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  34.59 
 
 		 305 aa  170  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0852  1-phosphofructokinase, putative  32.61 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.810869  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  35.58 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0619  1-phosphofructokinase  30.38 
 
 		 313 aa  155  9e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.502151  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl180  1-phosphofructokinase  34.07 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  34.97 
 
 		 311 aa  149  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  32.7 
 
 		 316 aa  149  8e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  36.16 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  33.94 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0148  fructose-1-phosphate kinase-like protein  34.98 
 
 		 308 aa  145  6e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000234171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  35.79 
 
 		 315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  29.51 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  30.72 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  35.33 
 
 		 325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  35.79 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  34.69 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0435  1-phosphofructokinase  30.41 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  35.9 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  35.79 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  35.04 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  31.64 
 
 		 324 aa  132  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  32.23 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  36.67 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  31.88 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  29.7 
 
 		 313 aa  129  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  30.36 
 
 		 308 aa  129  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1715  1-phosphofructokinase  35.27 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0124399  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  32.68 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  33.81 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  32.81 
 
 		 317 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  30.22 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  30.7 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  30.67 
 
 		 310 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  35 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  30.22 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  28.94 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  32.39 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  32.04 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  33.7 
 
 		 313 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  31.05 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  31.05 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  29.45 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  31.9 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  30.06 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1965  1-phosphofructokinase  28.48 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.261569  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  33.94 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  32.87 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  29.31 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  28.75 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  31.68 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  30.36 
 
 		 306 aa  116  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  32.73 
 
 		 327 aa  116  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  34.46 
 
 		 326 aa  116  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  27.24 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0650  1-phosphofructokinase  33.82 
 
 		 303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.934038  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  31.85 
 
 		 318 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  28.87 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  29.23 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  32 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  28.87 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  28.87 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  28.87 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  28.87 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  29.69 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  28.97 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0866  1-phosphofructokinase  27.85 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00871601  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  28.97 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  28.97 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  27.73 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  28.97 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>