More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_13150 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_13150  histidine kinase  100 
 
 		 436 aa  895    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0372  histidine kinase  50.8 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03600  histidine kinase  38.93 
 
 		 432 aa  251  2e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0707295 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1235  histidine kinase  34.79 
 
 		 434 aa  214  3.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.14404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00289243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1841  histidine kinase  39.29 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.033812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2176  hypothetical protein  39.22 
 
 		 400 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01831  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0527  histidine kinase  27.43 
 
 		 425 aa  169  8e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  36.33 
 
 		 429 aa  167  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 469 aa  160  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  36.25 
 
 		 430 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  36.25 
 
 		 430 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0984  sensor histidine kinase CiaH  33.59 
 
 		 437 aa  157  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.805926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  35 
 
 		 392 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0485  sensor histidine kinase  34.62 
 
 		 416 aa  156  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  39.04 
 
 		 477 aa  156  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  34.06 
 
 		 443 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 		 459 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  34.58 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  34.85 
 
 		 427 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 469 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 457 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  32.99 
 
 		 412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  33.85 
 
 		 416 aa  153  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 475 aa  152  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0635  sensor histidine kinase  34.23 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  35 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  34.62 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  35 
 
 		 416 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  35 
 
 		 416 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  33.97 
 
 		 436 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  34.44 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4223  histidine kinase  33.97 
 
 		 436 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  37 
 
 		 469 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 475 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  34.23 
 
 		 527 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 384 aa  147  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1969  histidine kinase  37.6 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  35 
 
 		 473 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2302  histidine kinase  34.04 
 
 		 408 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110141  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 		 415 aa  142  8e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000404489  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0737  histidine kinase  35.95 
 
 		 455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00375027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 489 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3933  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 422 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 480 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5188  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 482 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000262234 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1791  sensor histidine kinase  26.94 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  35.95 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  36.68 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10540  histidine kinase  35.06 
 
 		 511 aa  137  4e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 460 aa  137  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3865  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 420 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  35.96 
 
 		 482 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 458 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  35.96 
 
 		 482 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0711  Signal transduction histidine kinase  23.66 
 
 		 427 aa  136  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.890851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 584 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  35.96 
 
 		 482 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 585 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1809  Signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 432 aa  136  7.000000000000001e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000615791  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 447 aa  136  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 592 aa  136  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0143  Signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 458 aa  136  8e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  36.6 
 
 		 477 aa  136  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 815 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 473 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.631328  normal  0.769342 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  33.78 
 
 		 599 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 468 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  35.96 
 
 		 482 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3159  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 475 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  34.93 
 
 		 503 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 608 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 584 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 587 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  35.53 
 
 		 482 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  35.06 
 
 		 257 aa  133  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 442 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 584 aa  133  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 478 aa  132  9e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1545  histidine kinase  33.61 
 
 		 443 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  34.44 
 
 		 587 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  34.76 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1327  sensor histidine kinase  25.06 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0088456  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  34.44 
 
 		 587 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 587 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 474 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  27.13 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  34.76 
 
 		 469 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 571 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>