169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12800 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  100 
 
 
256 aa  512  1e-144  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  70.2 
 
 
256 aa  341  8e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  39.53 
 
 
257 aa  168  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  39.68 
 
 
248 aa  164  9e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  26.61 
 
 
259 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  26.44 
 
 
262 aa  98.6  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  28.03 
 
 
252 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  28.85 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  28.87 
 
 
266 aa  91.3  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  27.56 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  27.56 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  27.2 
 
 
267 aa  89  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  26.59 
 
 
264 aa  87.8  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  27.17 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  27.17 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  27.17 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  27.17 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  27.17 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  26.53 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  26.53 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  30.36 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  27.76 
 
 
267 aa  87  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  26.53 
 
 
264 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  26.04 
 
 
268 aa  85.5  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  27.6 
 
 
268 aa  85.5  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1608  cobalt transport protein  27.91 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  26.24 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  29.76 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  24.9 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  26.12 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.92 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.95 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  27.31 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  26.34 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  27.31 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  28.57 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  22.64 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  24.22 
 
 
270 aa  79  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  27.64 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  24.03 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  26.56 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0370  cobalt transport protein  24.31 
 
 
253 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  24.6 
 
 
267 aa  77  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  26.97 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  26.38 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  25.93 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  26.38 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  26.97 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  22.35 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.1 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  27.06 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  27.02 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  28.19 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  24.62 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  23.57 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  26.09 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  24.66 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  24.5 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  34.74 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  27.19 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  23.26 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  24.62 
 
 
275 aa  68.6  0.00000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  26.81 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  28.02 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3823  cobalt transport protein  26.77 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457934  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1693  cobalt transport protein  25.1 
 
 
265 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0637761  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  25.53 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  23.13 
 
 
291 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  27.8 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  32.32 
 
 
438 aa  66.2  0.0000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  22.78 
 
 
291 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3451  cobalt transport protein  30.64 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  25.48 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  21.59 
 
 
279 aa  64.7  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  24.05 
 
 
266 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  26.78 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0369  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.51 
 
 
273 aa  63.9  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  25.6 
 
 
287 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  29.41 
 
 
243 aa  63.5  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  23.9 
 
 
287 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  30 
 
 
276 aa  63.2  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  24.15 
 
 
266 aa  63.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  25.6 
 
 
266 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  26.07 
 
 
275 aa  62.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  25.48 
 
 
266 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1894  cobalt transport protein  31 
 
 
244 aa  62.4  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154103  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  29.49 
 
 
210 aa  62.4  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  26.15 
 
 
262 aa  62.4  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  25.12 
 
 
287 aa  62  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  25.12 
 
 
266 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  25.12 
 
 
273 aa  62  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  28.87 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  29.37 
 
 
273 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  24.11 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  27.93 
 
 
269 aa  61.6  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  23.77 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  24.71 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  21.84 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  31.3 
 
 
260 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.42 
 
 
267 aa  60.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>