44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12600 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  905    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  35.2 
 
 		 422 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  32.48 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  34.69 
 
 		 422 aa  227  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  34.95 
 
 		 417 aa  225  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  35.4 
 
 		 425 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  35.19 
 
 		 421 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4361  hypothetical protein  32.7 
 
 		 465 aa  209  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  33.26 
 
 		 438 aa  206  5e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  32.35 
 
 		 451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  30.7 
 
 		 433 aa  189  5.999999999999999e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2148  hypothetical protein  32.96 
 
 		 431 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  31.91 
 
 		 429 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  33.11 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  29.21 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  31.15 
 
 		 447 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  28.73 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1294  hypothetical protein  28.77 
 
 		 456 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  30.43 
 
 		 448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000340563  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3791  abortive phage resistance protein-like  30.43 
 
 		 448 aa  146  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.618475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  26.94 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1074  abortive phage resistance protein-like protein  27.27 
 
 		 456 aa  140  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  28.31 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  25.93 
 
 		 459 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  26.08 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  42.34 
 
 		 428 aa  120  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  24.41 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3852  abortive infection protein  25.23 
 
 		 394 aa  95.5  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000425466 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  25 
 
 		 400 aa  93.6  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  23.47 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3995  abortive infection protein, internal deletion  23.14 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2166  AAA ATPase  30.15 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000280978  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  21.94 
 
 		 407 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  20.91 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0024  recombination protein RecR  29.51 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000424013  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1118  SMC domain-containing protein  23.38 
 
 		 368 aa  54.3  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.266234  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2523  abortive infection protein  22.69 
 
 		 478 aa  50.1  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.237288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  28.68 
 
 		 437 aa  50.4  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4680  hypothetical protein  27.03 
 
 		 458 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  23.36 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0049  prophage Lp2 protein 4  41.67 
 
 		 558 aa  44.3  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.19169  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  29.31 
 
 		 430 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  20.79 
 
 		 397 aa  43.1  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  25.48 
 
 		 709 aa  43.1  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>