More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12420 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  100 
 
 
214 aa  442  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 
204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 
208 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  32.81 
 
 
203 aa  98.2  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  33.68 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  32.81 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  32.11 
 
 
203 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  32.29 
 
 
203 aa  96.3  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  32.11 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  31.89 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  34.9 
 
 
189 aa  94.4  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  35.82 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  31.18 
 
 
203 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  30.65 
 
 
203 aa  92  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  29.8 
 
 
452 aa  88.2  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  31.48 
 
 
219 aa  88.2  9e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.06 
 
 
442 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  32.83 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.31 
 
 
442 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 
211 aa  85.5  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.91 
 
 
442 aa  85.5  6e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 
217 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  31.71 
 
 
207 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  31.71 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.66 
 
 
442 aa  82.8  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0545  Phosphoglycerate mutase  35.86 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000658499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.91 
 
 
442 aa  82  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  32.64 
 
 
447 aa  81.6  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  27.94 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  30.32 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 
213 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  32.71 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  32.96 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.43 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.43 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  30.73 
 
 
202 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  26.09 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.41 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.41 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 
448 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0752  phosphoglycerate mutase family protein  34.34 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 
448 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  31.43 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  35.21 
 
 
459 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  30.24 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  31.02 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  27.55 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.2 
 
 
442 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.81 
 
 
444 aa  75.1  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.64 
 
 
442 aa  74.7  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  29.76 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  30.93 
 
 
445 aa  74.3  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  29.9 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.45 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  33 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.46 
 
 
449 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1516  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.481804 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  33.87 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  30.61 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  25.13 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  28.14 
 
 
447 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34127  putative phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.375403 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0724  Phosphoglycerate mutase  27.41 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0153538  normal  0.0816175 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.93 
 
 
191 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 
216 aa  72  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 
213 aa  72  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
207 aa  72  0.000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>