More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12210 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  100 
 
 
399 aa  812    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  63.98 
 
 
404 aa  529  1e-149  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  59.95 
 
 
414 aa  488  1e-136  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  52.12 
 
 
403 aa  419  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  52.12 
 
 
403 aa  419  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  49.37 
 
 
404 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  50.38 
 
 
401 aa  413  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  51.5 
 
 
408 aa  409  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  51.26 
 
 
399 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  50.37 
 
 
398 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  50.87 
 
 
398 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  52.24 
 
 
401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  49.38 
 
 
399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  47.74 
 
 
399 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  49.25 
 
 
398 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  48.49 
 
 
397 aa  398  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  47.24 
 
 
397 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  51.38 
 
 
406 aa  396  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  51.75 
 
 
406 aa  395  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  49.62 
 
 
396 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  48.88 
 
 
401 aa  392  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  49.37 
 
 
397 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  47.74 
 
 
405 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  49.62 
 
 
397 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  50.51 
 
 
397 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  50.13 
 
 
397 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  50.13 
 
 
397 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  50.13 
 
 
397 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  50.13 
 
 
397 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  50.13 
 
 
397 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  50.13 
 
 
397 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  50.13 
 
 
397 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  50.13 
 
 
397 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  50.38 
 
 
397 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  48.12 
 
 
397 aa  390  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  47.59 
 
 
398 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  49.12 
 
 
395 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  49.87 
 
 
397 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  46.73 
 
 
396 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  47.49 
 
 
398 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  49.24 
 
 
397 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  49.37 
 
 
397 aa  380  1e-104  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25160  acetate kinase  50.12 
 
 
403 aa  378  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.748189  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  49.88 
 
 
401 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  47.57 
 
 
417 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  48.75 
 
 
397 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000914313  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  48.77 
 
 
402 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  48.72 
 
 
400 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  46.98 
 
 
398 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  48.61 
 
 
402 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2277  acetate kinase  46.63 
 
 
421 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000044561  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  48.72 
 
 
400 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  47.49 
 
 
398 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  46.38 
 
 
421 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  47.59 
 
 
421 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  47.47 
 
 
397 aa  365  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  44.44 
 
 
417 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  45.02 
 
 
421 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  43.64 
 
 
421 aa  360  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  47.59 
 
 
398 aa  359  4e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  47.28 
 
 
404 aa  359  5e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  46.02 
 
 
402 aa  358  6e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  44.89 
 
 
420 aa  358  7e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  43.42 
 
 
421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  45.02 
 
 
421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  43.78 
 
 
421 aa  355  6.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  43.86 
 
 
398 aa  355  1e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  46.87 
 
 
399 aa  354  2e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0296  acetate kinase  48.14 
 
 
403 aa  352  7e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0168  acetate kinase  46.1 
 
 
397 aa  351  1e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.14758  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  46.48 
 
 
399 aa  350  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0920  acetate kinase  46.23 
 
 
414 aa  348  9e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  43.87 
 
 
406 aa  347  2e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  46.12 
 
 
398 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  44.11 
 
 
396 aa  346  4e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2295  acetate kinase  46.33 
 
 
395 aa  345  8e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2294  acetate kinase  44.02 
 
 
395 aa  343  2e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  45.66 
 
 
411 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  46.62 
 
 
409 aa  342  5.999999999999999e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  44.33 
 
 
404 aa  340  2e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  45.55 
 
 
398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1834  acetate kinase  46.73 
 
 
397 aa  339  5.9999999999999996e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000432075  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  43.5 
 
 
413 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2578  acetate kinase  45.98 
 
 
408 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.406613  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  43.69 
 
 
398 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  43.47 
 
 
399 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  42.72 
 
 
399 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  43.47 
 
 
399 aa  335  9e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  43.47 
 
 
399 aa  335  9e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  43.99 
 
 
398 aa  334  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  43.47 
 
 
399 aa  334  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  42.96 
 
 
400 aa  334  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0469  acetate kinase  42.58 
 
 
419 aa  333  3e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0464018  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  41.98 
 
 
399 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  41.98 
 
 
399 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  41.98 
 
 
399 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  44.55 
 
 
404 aa  332  6e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  41.98 
 
 
399 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0328  acetate kinase  45.61 
 
 
409 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000406693 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1180  acetate kinase  44.33 
 
 
414 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>