More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11820 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_11820  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  100 
 
 
285 aa  597  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00376566 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0509  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.81 
 
 
287 aa  184  2e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1138  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.65 
 
 
284 aa  181  9e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131341  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1231  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.65 
 
 
284 aa  181  9e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1118  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.65 
 
 
284 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000464599  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1338  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.38 
 
 
284 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.326275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1299  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.3 
 
 
284 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423325 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1376  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35 
 
 
284 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580619  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1112  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.94 
 
 
284 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0345479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1125  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.45 
 
 
284 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.110653  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0599  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.51 
 
 
294 aa  164  2e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0481  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.51 
 
 
294 aa  164  2e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.33 
 
 
281 aa  162  5e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1270  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.39 
 
 
246 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4071  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.96 
 
 
237 aa  152  6e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0940  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.48 
 
 
283 aa  147  1e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1416  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.92 
 
 
281 aa  146  4e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547009  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2525  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.9 
 
 
298 aa  142  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2472  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.67 
 
 
280 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1699  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.06 
 
 
280 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0285308 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3036  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.07 
 
 
283 aa  137  3e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4467  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.96 
 
 
287 aa  136  3e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1750  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.22 
 
 
283 aa  135  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.963734 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4140  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.22 
 
 
287 aa  134  2e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  1.98546e-06 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2365  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.93 
 
 
280 aa  134  2e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304818  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1071  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.79 
 
 
285 aa  134  2e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3679  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.82 
 
 
285 aa  133  4e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.49825e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3073  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.17 
 
 
282 aa  131  1e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.419885  normal  0.223963 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1580  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.05 
 
 
278 aa  131  1e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4129  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.35 
 
 
461 aa  129  4e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.671731  hitchhiker  8.41547e-09 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0953  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.91 
 
 
281 aa  129  4e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.719428  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2097  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.94 
 
 
280 aa  128  1e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3272  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.25 
 
 
276 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0328  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.56 
 
 
278 aa  125  8e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1724  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.04 
 
 
296 aa  124  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00037704  normal  0.832838 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1686  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.93 
 
 
285 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3135  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.2 
 
 
282 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3355  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.41 
 
 
296 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.909711  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0306  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.43 
 
 
283 aa  122  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3106  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.8 
 
 
278 aa  122  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1531  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.92 
 
 
284 aa  122  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.158917  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2828  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.76 
 
 
291 aa  122  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.39163  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3018  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.4 
 
 
281 aa  120  2e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2594  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.36 
 
 
314 aa  120  2e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13108  putative dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.54 
 
 
288 aa  120  2e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1779  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.03 
 
 
297 aa  120  2e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00243798  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2048  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.03 
 
 
300 aa  119  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1006  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.9 
 
 
299 aa  119  8e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.530196  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2402  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.46 
 
 
286 aa  116  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1653  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.2 
 
 
328 aa  116  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2129  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.96 
 
 
286 aa  115  1e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1996  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.14 
 
 
290 aa  114  1e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2262  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.44 
 
 
294 aa  114  1e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0627  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.58 
 
 
287 aa  114  1e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.144272 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2661  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.76 
 
 
291 aa  114  1e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0045  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.99 
 
 
288 aa  114  1e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.478799 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1344  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.43 
 
 
293 aa  114  2e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1054  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.07 
 
 
281 aa  114  2e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1659  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.07 
 
 
277 aa  113  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0254  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.96 
 
 
283 aa  113  4e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  4.86675e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2292  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.17 
 
 
292 aa  112  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3917  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.71 
 
 
284 aa  112  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0252378 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2344  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.97 
 
 
298 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.38 
 
 
291 aa  112  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.682696  hitchhiker  2.83984e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3891  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.17 
 
 
294 aa  112  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1891  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.58 
 
 
286 aa  112  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.657644  hitchhiker  0.00910437 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0515  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.21 
 
 
291 aa  112  7e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1621  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.21 
 
 
278 aa  111  1e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3020  dTDP-6-deoxy-l-mannose-dehydrogenase  31.33 
 
 
293 aa  111  1e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.361116  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1487  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.37 
 
 
294 aa  111  1e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0027e-07 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4724  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.48 
 
 
300 aa  111  1e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.004454 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17350  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.96 
 
 
287 aa  111  1e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1473  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.78 
 
 
381 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3345  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.47 
 
 
278 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3463  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.25 
 
 
294 aa  109  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585813  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2011  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.52 
 
 
306 aa  109  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.73104  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1063  hypothetical protein  26.64 
 
 
290 aa  108  7e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1403  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.38 
 
 
288 aa  108  8e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00211248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1509  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.32 
 
 
287 aa  108  9e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1420  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.01 
 
 
279 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1445  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.56 
 
 
283 aa  107  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0416  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.3 
 
 
293 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128844  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0633  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.75 
 
 
285 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0627  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.54 
 
 
298 aa  106  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.338486 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2763  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.82 
 
 
295 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0492  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.02 
 
 
296 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.37943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2316  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.33 
 
 
297 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0781595 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1444  dTDP-4-keto-L-rhamnose reductase  26.69 
 
 
283 aa  106  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0478  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.02 
 
 
296 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1727  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.61 
 
 
284 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.681532  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1209  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.2 
 
 
284 aa  105  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0900  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.6 
 
 
278 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34862e-32 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1239  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.25 
 
 
298 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.181567  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1193  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.13 
 
 
299 aa  105  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3287  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.18 
 
 
290 aa  105  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1617  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.64 
 
 
285 aa  105  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.199276  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4945  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.09 
 
 
286 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  4.89214e-06 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1537  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.13 
 
 
275 aa  104  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00194378  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1276  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.18 
 
 
300 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2138  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.25 
 
 
296 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>