More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10950 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  100 
 
 		 95 aa  192  9e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1629  ribosomal protein S15  80 
 
 		 95 aa  159  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.232909  hitchhiker  0.0000867446 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07610  SSU ribosomal protein S15P  80 
 
 		 95 aa  157  4e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.923789 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  62.64 
 
 		 92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 90 aa  120  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  60.23 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 89 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 89 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  60.23 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  59.09 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  110  8.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  59.3 
 
 		 88 aa  110  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  55.81 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3639  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3577  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3540  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0533  ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3471  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3471  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03032  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3606  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  55.81 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3461  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.22404 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0727  30S ribosomal protein S15  57.78 
 
 		 93 aa  108  3e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0483  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397496  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0533  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  55.81 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  55.81 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3649  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02983  hypothetical protein  53.41 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  59.49 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0437  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0337  30S ribosomal protein S15  60 
 
 		 93 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.240958  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  56.96 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4485  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  58.62 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  57.69 
 
 		 100 aa  107  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  52.27 
 
 		 89 aa  107  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  106  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  107  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  106  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0034  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  106  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>