More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10890 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 201 aa  409  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1558  lipoprotein signal peptidase  49.09 
 
 		 179 aa  150  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.714607  decreased coverage  0.00460941 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  44.65 
 
 		 173 aa  122  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 145 aa  95.9  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 		 163 aa  92.8  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 		 157 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 		 165 aa  89.7  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 		 157 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  35.22 
 
 		 174 aa  84.7  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  37.23 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  35.48 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  35.15 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 169 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  35.62 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  42.57 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  35.56 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 168 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 171 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 171 aa  72  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  35.19 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  30.43 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  34.11 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 		 165 aa  71.2  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  35.19 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  34.15 
 
 		 161 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  37.18 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  31.64 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0885  lipoprotein signal peptidase  28.29 
 
 		 152 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0111972  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  32.85 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  31.45 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  37.68 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  32.21 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  34.05 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  31.65 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  34.57 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  31.13 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  36.03 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  28.24 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  33.95 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09981  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 152 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  32.5 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0014  lipoprotein signal peptidase  33.58 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  33.95 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  33.95 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 163 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  30.06 
 
 		 167 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3937  lipoprotein signal peptidase  29.66 
 
 		 166 aa  67  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  35.21 
 
 		 157 aa  67  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  30.06 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  38.73 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  33.95 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09461  lipoprotein signal peptidase  32.17 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  33.14 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  34.09 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  33.95 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  33.14 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  33.14 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  32.54 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  32.19 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  33.14 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  30.54 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 272 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  32.3 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0472  lipoprotein signal peptidase  31.25 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  36.11 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  32.26 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  34.57 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  31.36 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>