More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10870 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_10870  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
294 aa  608  1e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84065  unclonable  0.00000000208596 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00180  methionine aminopeptidase, type I  79.31 
 
 
290 aa  480  1e-134  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.55421 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2356  methionine aminopeptidase, type I  71.43 
 
 
294 aa  447  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.919719  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1375  methionine aminopeptidase, type I  58.95 
 
 
289 aa  358  7e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0048562  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1635  methionine aminopeptidase, type I  58.6 
 
 
289 aa  356  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.092319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3439  methionine aminopeptidase, type I  55.28 
 
 
289 aa  342  5e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0407215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3479  methionine aminopeptidase, type I  52.98 
 
 
291 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.234162  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3362  methionine aminopeptidase, type I  49.43 
 
 
270 aa  286  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1733  putative methionine aminopeptidase  49.81 
 
 
266 aa  268  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.491997  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
258 aa  250  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0969  methionine aminopeptidase, type I  46.15 
 
 
277 aa  249  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1138  methionine aminopeptidase  48.62 
 
 
266 aa  246  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000518116  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  50.41 
 
 
261 aa  244  9e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0240  methionine aminopeptidase  43.15 
 
 
291 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  43.99 
 
 
297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  50 
 
 
260 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  50 
 
 
260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  51.22 
 
 
260 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  50.6 
 
 
267 aa  238  5.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2642  methionine aminopeptidase  46.83 
 
 
278 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000168885  normal  0.351065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2709  methionine aminopeptidase  46.83 
 
 
278 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00736812  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  50 
 
 
260 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  50 
 
 
260 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  50 
 
 
260 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  50 
 
 
260 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1269  methionine aminopeptidase  46.61 
 
 
265 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210872  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2816  methionine aminopeptidase  46.43 
 
 
278 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000497002  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1627  methionine aminopeptidase  46.22 
 
 
265 aa  236  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1553  methionine aminopeptidase  46.61 
 
 
265 aa  236  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
260 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  47.15 
 
 
256 aa  236  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1347  methionine aminopeptidase  45.82 
 
 
278 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000200998  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  51.19 
 
 
266 aa  235  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0442  methionine aminopeptidase, type I  45.63 
 
 
264 aa  235  6e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  47.97 
 
 
260 aa  235  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  48.58 
 
 
262 aa  234  9e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0396  methionine aminopeptidase, type I  45.24 
 
 
264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  48.37 
 
 
258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2636  methionine aminopeptidase  45.82 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406904  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
261 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  47.56 
 
 
261 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  49.19 
 
 
259 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
259 aa  232  5e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1052  methionine aminopeptidase, type I  48.57 
 
 
261 aa  232  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  48.62 
 
 
268 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  46.22 
 
 
269 aa  231  9e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1444  methionine aminopeptidase  45.02 
 
 
268 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000385139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1449  methionine aminopeptidase  45.02 
 
 
268 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000120153  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2903  methionine aminopeptidase  45.02 
 
 
268 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00196224  normal  0.258736 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1480  methionine aminopeptidase  45.02 
 
 
268 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000568537  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  47.58 
 
 
263 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  47.81 
 
 
267 aa  229  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1852  methionine aminopeptidase  44.11 
 
 
280 aa  229  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000190489  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3427  methionine aminopeptidase, type I  47.76 
 
 
261 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3022  methionine aminopeptidase, type I  47.97 
 
 
255 aa  229  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0974756  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3273  methionine aminopeptidase, type I  47.56 
 
 
261 aa  229  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3406  methionine aminopeptidase, type I  47.56 
 
 
261 aa  229  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0935  methionine aminopeptidase, type I  47.56 
 
 
261 aa  229  6e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0961494  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  48.99 
 
 
284 aa  228  6e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0828  methionine aminopeptidase  45.53 
 
 
267 aa  228  7e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.296113  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  47.37 
 
 
255 aa  228  9e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  49.15 
 
 
274 aa  227  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3162  methionine aminopeptidase  43.82 
 
 
265 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00027219  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  47.97 
 
 
258 aa  227  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1271  methionine aminopeptidase, type I  45.83 
 
 
285 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0521675  normal  0.309008 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0557  methionine aminopeptidase, type I  45.6 
 
 
266 aa  227  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.484124  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  46.77 
 
 
258 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0221  hypothetical protein  45.34 
 
 
253 aa  226  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  46.77 
 
 
270 aa  226  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3282  methionine aminopeptidase  45.02 
 
 
265 aa  226  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000794672  hitchhiker  0.0000144576 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0506  methionine aminopeptidase, type I  47.77 
 
 
278 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.224089  normal  0.874449 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  45.34 
 
 
264 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  45.34 
 
 
264 aa  226  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  45.34 
 
 
264 aa  226  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  45.34 
 
 
264 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2428  methionine aminopeptidase  44.96 
 
 
275 aa  226  4e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25788  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  47.97 
 
 
268 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  45.34 
 
 
264 aa  226  4e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  48.21 
 
 
271 aa  226  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  45.34 
 
 
264 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  45.34 
 
 
264 aa  226  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  45.34 
 
 
264 aa  226  4e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  45.34 
 
 
264 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  47.01 
 
 
266 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1550  methionine aminopeptidase  45.97 
 
 
262 aa  225  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  47.43 
 
 
268 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  47.43 
 
 
268 aa  225  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2886  methionine aminopeptidase  43.65 
 
 
266 aa  225  7e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00071423  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  45.75 
 
 
260 aa  225  9e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  45.93 
 
 
258 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  47.43 
 
 
268 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  43.95 
 
 
263 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2076  methionine aminopeptidase, type I  44.08 
 
 
277 aa  224  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  47.43 
 
 
268 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  47.37 
 
 
264 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  46.75 
 
 
255 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  47.37 
 
 
264 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  47.04 
 
 
268 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  47.37 
 
 
264 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>