203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10590 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  100 
 
 		 1081 aa  2154    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  28.31 
 
 		 1039 aa  362  2e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  29.39 
 
 		 1018 aa  324  5e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  26.01 
 
 		 1009 aa  260  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  30.23 
 
 		 1049 aa  260  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  48.64 
 
 		 1038 aa  230  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  55.56 
 
 		 953 aa  221  5e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  31.19 
 
 		 1029 aa  213  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  29.51 
 
 		 1029 aa  212  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  29.74 
 
 		 1029 aa  212  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  29.74 
 
 		 1029 aa  211  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  29.38 
 
 		 1029 aa  211  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  32.26 
 
 		 1018 aa  207  7e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  31.19 
 
 		 1029 aa  206  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  31.19 
 
 		 1029 aa  205  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  31.02 
 
 		 1029 aa  204  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  31.02 
 
 		 1029 aa  204  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  31.02 
 
 		 1029 aa  204  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  28.12 
 
 		 1029 aa  203  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  31.69 
 
 		 1018 aa  203  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  29.87 
 
 		 1018 aa  186  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  34.93 
 
 		 1018 aa  180  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  41.36 
 
 		 1018 aa  178  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  41.36 
 
 		 1018 aa  178  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  41.36 
 
 		 1018 aa  178  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  41.33 
 
 		 1018 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  41.78 
 
 		 1018 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  39.41 
 
 		 1018 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  41.1 
 
 		 1018 aa  174  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  41.78 
 
 		 986 aa  173  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  44.81 
 
 		 1020 aa  173  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  40.68 
 
 		 1018 aa  173  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  39.74 
 
 		 1018 aa  172  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  41.54 
 
 		 1013 aa  166  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  26.68 
 
 		 1033 aa  164  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  40.79 
 
 		 1030 aa  162  4e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  29.56 
 
 		 1047 aa  160  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  41.27 
 
 		 962 aa  160  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  44.02 
 
 		 1018 aa  160  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  42.36 
 
 		 1020 aa  159  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  39.7 
 
 		 1291 aa  155  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  38.69 
 
 		 881 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  48.12 
 
 		 1009 aa  152  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  48.12 
 
 		 1009 aa  152  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  48.33 
 
 		 1017 aa  151  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  43.61 
 
 		 1020 aa  148  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  36.07 
 
 		 1022 aa  146  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  40.33 
 
 		 989 aa  144  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  43.4 
 
 		 1025 aa  143  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  42.86 
 
 		 1046 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  35.16 
 
 		 1011 aa  135  6e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  42.78 
 
 		 995 aa  134  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  43.87 
 
 		 1059 aa  133  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  36.55 
 
 		 995 aa  132  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  34.23 
 
 		 1023 aa  132  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  32.08 
 
 		 1046 aa  131  6e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  41.05 
 
 		 1024 aa  130  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  35.19 
 
 		 1249 aa  128  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  35.65 
 
 		 986 aa  126  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  36.02 
 
 		 1091 aa  125  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  40.43 
 
 		 1009 aa  124  8e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  41.43 
 
 		 1191 aa  123  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  34.09 
 
 		 1307 aa  121  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  46.1 
 
 		 1346 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  33.08 
 
 		 1085 aa  119  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  46.75 
 
 		 1303 aa  118  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  32.89 
 
 		 1224 aa  118  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  34.7 
 
 		 1230 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  41.34 
 
 		 1058 aa  115  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  35.09 
 
 		 1226 aa  115  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  38.83 
 
 		 1006 aa  112  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  40.26 
 
 		 1219 aa  110  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  40 
 
 		 1223 aa  110  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  33.79 
 
 		 1223 aa  108  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  25.86 
 
 		 1029 aa  104  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  37.37 
 
 		 1101 aa  103  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  25.51 
 
 		 1114 aa  103  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  38.26 
 
 		 1234 aa  99.4  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  29.86 
 
 		 906 aa  99  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  38.98 
 
 		 1144 aa  99  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  34.33 
 
 		 1214 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  38.96 
 
 		 1227 aa  97.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  35.47 
 
 		 1213 aa  95.9  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  30.88 
 
 		 910 aa  95.9  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  36.06 
 
 		 1238 aa  94  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  35.75 
 
 		 1214 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  40.27 
 
 		 1155 aa  93.6  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  28.95 
 
 		 1232 aa  91.7  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  41.29 
 
 		 1226 aa  91.7  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  38.18 
 
 		 1214 aa  91.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  38.18 
 
 		 1214 aa  91.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  36.16 
 
 		 1214 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  37.34 
 
 		 1211 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  37.34 
 
 		 1211 aa  89.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  36.47 
 
 		 1099 aa  89.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  46.34 
 
 		 1165 aa  89  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  42.57 
 
 		 1265 aa  88.2  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  38.71 
 
 		 1227 aa  86.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  38.71 
 
 		 1227 aa  86.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  22.38 
 
 		 961 aa  86.7  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>