More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10410 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_10410  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 319 aa  645    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000307116  unclonable  0.00000000139433 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1408  DNA protecting protein DprA  58.06 
 
 		 305 aa  319  3.9999999999999996e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.313803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07040  DNA protecting protein DprA  52.38 
 
 		 328 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.688401  normal  0.79238 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0702  SMF family protein  38.69 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000212454  unclonable  0.0000000268506 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20450  predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake  46.89 
 
 		 231 aa  186  6e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal  0.263835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  37.33 
 
 		 389 aa  169  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  38.41 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  44.44 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  37.22 
 
 		 356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  34.59 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  34.59 
 
 		 337 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  38.11 
 
 		 358 aa  162  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  34.75 
 
 		 366 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  36.05 
 
 		 394 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 374 aa  159  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  36.3 
 
 		 359 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  34.11 
 
 		 370 aa  159  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  36.33 
 
 		 373 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  43.06 
 
 		 385 aa  156  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  41.21 
 
 		 364 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  46.11 
 
 		 365 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  32.17 
 
 		 356 aa  155  7e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  34.19 
 
 		 369 aa  155  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  36.6 
 
 		 366 aa  155  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.52 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  35.37 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  35.91 
 
 		 385 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  41.51 
 
 		 362 aa  153  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  35.32 
 
 		 373 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  32.8 
 
 		 333 aa  152  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  35.4 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  41.56 
 
 		 365 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  35.22 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  32.68 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  35.91 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  36.63 
 
 		 361 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  41.87 
 
 		 365 aa  150  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  35.4 
 
 		 361 aa  149  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  35.4 
 
 		 361 aa  149  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0018  DNA protecting protein DprA  41.33 
 
 		 442 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.256916 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  43.65 
 
 		 368 aa  149  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  30.43 
 
 		 375 aa  149  8e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  34.59 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  40.1 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1348  DNA protecting protein DprA  36.09 
 
 		 361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0122196  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  39.73 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  39.66 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  40.87 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  35.22 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  29.43 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  34.09 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  35.12 
 
 		 364 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  44.79 
 
 		 360 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  40.1 
 
 		 360 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  40.69 
 
 		 365 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  35.39 
 
 		 377 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  32.29 
 
 		 399 aa  146  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  42.86 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  35.88 
 
 		 372 aa  146  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  33.9 
 
 		 359 aa  146  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  43.94 
 
 		 362 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  38.89 
 
 		 383 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  42.18 
 
 		 375 aa  145  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  34.3 
 
 		 374 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  35.33 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  34.56 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  42.71 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  34.3 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  34.3 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  34.3 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  35.62 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  31.91 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  43.6 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  41.83 
 
 		 364 aa  143  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  32.44 
 
 		 369 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  36.13 
 
 		 380 aa  142  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  41.95 
 
 		 394 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  45.31 
 
 		 360 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  32.89 
 
 		 372 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  41.05 
 
 		 389 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  35.55 
 
 		 402 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  33.67 
 
 		 379 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  34.56 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  45.85 
 
 		 386 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  36.08 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4608  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1766  SMF protein  41.04 
 
 		 286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.273008 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3587  DNA protecting protein DprA  37.2 
 
 		 375 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.81 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  36 
 
 		 379 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1609  DNA protecting protein DprA  41.41 
 
 		 264 aa  139  6e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.709828  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  39.39 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  38.31 
 
 		 363 aa  139  7e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  33.88 
 
 		 381 aa  139  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  40.38 
 
 		 367 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  35.09 
 
 		 408 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  32.35 
 
 		 393 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 375 aa  138  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  36.6 
 
 		 362 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  34.67 
 
 		 379 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>