More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10370 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  100 
 
 		 114 aa  224  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  78.57 
 
 		 115 aa  173  9e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  75.89 
 
 		 114 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  65.18 
 
 		 114 aa  154  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0698  ribosomal protein L19  67.26 
 
 		 113 aa  152  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000127437  hitchhiker  0.00000355367 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 113 aa  147  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  63.64 
 
 		 115 aa  145  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  63.39 
 
 		 124 aa  144  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0507  50S ribosomal protein L19  62.28 
 
 		 116 aa  144  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 		 114 aa  143  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0198  ribosomal protein L19  63.3 
 
 		 115 aa  143  8.000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000492639  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 113 aa  143  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 		 116 aa  142  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  66 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 115 aa  141  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2219  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 119 aa  140  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000293705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 116 aa  140  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 118 aa  140  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2479  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 119 aa  140  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 118 aa  140  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  65.35 
 
 		 121 aa  140  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0885  50S ribosomal protein L19  66.06 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0069103  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3678  ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 196 aa  139  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09190  LSU ribosomal protein L19P  57.39 
 
 		 117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 114 aa  138  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 114 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  65.35 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 113 aa  137  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0720  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 121 aa  136  8.999999999999999e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  58.41 
 
 		 119 aa  136  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  58.18 
 
 		 113 aa  135  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 116 aa  135  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  62.28 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1680  50S ribosomal protein L19  63.11 
 
 		 117 aa  135  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.167471  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  57.39 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 		 115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  60.91 
 
 		 114 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 118 aa  134  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 113 aa  134  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  57.89 
 
 		 127 aa  133  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 		 115 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 115 aa  134  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 115 aa  134  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1274  ribosomal protein L19  58.77 
 
 		 118 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  57.39 
 
 		 121 aa  133  7.000000000000001e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2304  ribosomal protein L19  57.39 
 
 		 117 aa  133  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000980437  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  57.8 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 114 aa  133  9e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  57.89 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  57.27 
 
 		 116 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 116 aa  130  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 116 aa  130  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 		 166 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  53.33 
 
 		 129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1095  50S ribosomal protein L19  60.91 
 
 		 115 aa  130  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 114 aa  130  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10020  LSU ribosomal protein L19P  55.65 
 
 		 116 aa  130  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.155501  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 133 aa  130  6.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  56.14 
 
 		 124 aa  130  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 		 163 aa  129  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  53.33 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  53.78 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  53.78 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1790  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  62 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  56.52 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0348  ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  61.39 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  62.63 
 
 		 116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 113 aa  127  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0463  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0439  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  62.63 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 113 aa  127  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 113 aa  127  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1024  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.688153  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  52.94 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  53.45 
 
 		 125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1093  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00704919  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1831  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 117 aa  127  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>