More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10340 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_10340  MiaB-like tRNA modifying enzyme  100 
 
 		 409 aa  836    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0729922  unclonable  0.00000000167703 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07660  MiaB-like tRNA modifying enzyme  54.31 
 
 		 409 aa  417  9.999999999999999e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.738464 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1645  MiaB-like tRNA modifying enzyme  55.72 
 
 		 410 aa  414  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.447021  hitchhiker  0.00298865 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0795  RNA modification enzyme, MiaB family  38.39 
 
 		 423 aa  263  4e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.134555  normal  0.773593 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  37 
 
 		 451 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  39.06 
 
 		 450 aa  256  7e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  36.71 
 
 		 449 aa  255  9e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  38.02 
 
 		 450 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  38.02 
 
 		 450 aa  253  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  38.02 
 
 		 450 aa  253  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  38.02 
 
 		 450 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  38.02 
 
 		 450 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  38.46 
 
 		 450 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  38.46 
 
 		 450 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  38.02 
 
 		 450 aa  253  6e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  38.02 
 
 		 450 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.96 
 
 		 438 aa  252  8.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  37.76 
 
 		 450 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  38.61 
 
 		 448 aa  251  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  38.61 
 
 		 448 aa  251  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  36.22 
 
 		 436 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  36.97 
 
 		 448 aa  242  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.41 
 
 		 471 aa  241  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  34.99 
 
 		 446 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.48 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.33 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.21 
 
 		 450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  41.5 
 
 		 437 aa  234  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.13 
 
 		 434 aa  231  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11680  RNA modification enzyme, MiaB family  33.33 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0952269  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.77 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  32.61 
 
 		 431 aa  230  3e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  35.44 
 
 		 454 aa  227  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.31 
 
 		 434 aa  227  3e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  37.67 
 
 		 439 aa  226  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.76 
 
 		 449 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  33.61 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  35.64 
 
 		 435 aa  223  6e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1728  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.87 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.479022  decreased coverage  0.00502843 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0588  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.13 
 
 		 450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  32.2 
 
 		 434 aa  219  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1711  hypothetical protein  37.02 
 
 		 436 aa  217  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.95 
 
 		 432 aa  216  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2282  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.69 
 
 		 434 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.69 
 
 		 434 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.63 
 
 		 466 aa  216  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2207  RNA modification enzyme, MiaB family  35.9 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2352  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.45 
 
 		 443 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6072  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.97 
 
 		 449 aa  215  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0928741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.26 
 
 		 456 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000454579  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0422  RNA modification protein  36.57 
 
 		 446 aa  212  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0536856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.05 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.31 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2445  RNA modification enzyme, MiaB family  32.51 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.839572  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2599  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  34.15 
 
 		 487 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000474817  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1211  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.39 
 
 		 495 aa  210  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.496163 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0976  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.22 
 
 		 467 aa  210  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.96 
 
 		 429 aa  209  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0174  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.05 
 
 		 430 aa  209  8e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.36 
 
 		 441 aa  209  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.59 
 
 		 471 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.43 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.6 
 
 		 435 aa  207  4e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000207484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2316  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.52 
 
 		 427 aa  206  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1501  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.46 
 
 		 471 aa  206  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  32.14 
 
 		 451 aa  206  8e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0223  hypothetical protein  32.51 
 
 		 441 aa  206  9e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.180201 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1886  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.05 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000824769  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.79 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000562047  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.14 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0783  RNA modification protein  35.16 
 
 		 480 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0783  RNA modification enzyme, MiaB family  34.1 
 
 		 438 aa  204  3e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1294  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.11 
 
 		 409 aa  204  3e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1996  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.47 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0566  hypothetical protein  33.07 
 
 		 470 aa  203  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.59061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1350  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.91 
 
 		 449 aa  202  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.91 
 
 		 420 aa  202  7e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1699  RNA modification enzyme, MiaB family  31.56 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000319842  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2224  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.07 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.490633  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3405  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.53 
 
 		 435 aa  200  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.17 
 
 		 441 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2064  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  36.1 
 
 		 444 aa  199  7.999999999999999e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3911  RNA modification enzyme, MiaB family  35.77 
 
 		 483 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0689  RNA modification enzyme, MiaB family  36.93 
 
 		 440 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2208  RNA modification enzyme, MiaB family  35.56 
 
 		 528 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494815  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1462  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  33.74 
 
 		 522 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0962  MiaB family tRNA modification protein  33.16 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3847  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.77 
 
 		 496 aa  197  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2225  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  35.88 
 
 		 502 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0503  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.29 
 
 		 408 aa  197  4.0000000000000005e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1197  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.73 
 
 		 523 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000761282  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0853  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.98 
 
 		 416 aa  196  6e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.230835  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.82 
 
 		 439 aa  196  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  33.42 
 
 		 447 aa  195  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0926  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.33 
 
 		 427 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.084888  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0298  RNA modification enzyme, MiaB family  35.75 
 
 		 431 aa  195  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4070  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.94 
 
 		 424 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3801  RNA modification enzyme, MiaB family  31.99 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.920944  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1495  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  29.37 
 
 		 451 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.421573  hitchhiker  0.000974888 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1737  2-methylthioadenine synthetase  33.43 
 
 		 438 aa  194  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.131145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>