249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10320 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  100 
 
 		 336 aa  677    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.88 
 
 		 337 aa  392  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  51.31 
 
 		 336 aa  332  8e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.31 
 
 		 340 aa  206  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  36.69 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  37.08 
 
 		 337 aa  199  7e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.28 
 
 		 351 aa  196  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  36.36 
 
 		 343 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.52 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  34.47 
 
 		 351 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.35 
 
 		 344 aa  192  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.13 
 
 		 343 aa  192  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.26 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.48 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.04 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.17 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  34.81 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.55 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.98 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.13 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.71 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.41 
 
 		 343 aa  185  8e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  36.2 
 
 		 337 aa  185  9e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  35.26 
 
 		 341 aa  185  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.88 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  35.38 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.37 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.23 
 
 		 347 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.93 
 
 		 343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.24 
 
 		 343 aa  182  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  34.2 
 
 		 339 aa  182  9.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  35.58 
 
 		 339 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.76 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.58 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  34.32 
 
 		 340 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 		 337 aa  179  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.24 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.48 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.88 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.94 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  34.44 
 
 		 343 aa  176  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  30.61 
 
 		 344 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.04 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  34.23 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.04 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  34.23 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  34.23 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.88 
 
 		 348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.08 
 
 		 344 aa  172  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.81 
 
 		 344 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.22 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.28 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  31.29 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.8 
 
 		 340 aa  169  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.13 
 
 		 344 aa  169  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.04 
 
 		 340 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  30.99 
 
 		 339 aa  169  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.96 
 
 		 341 aa  169  7e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.45 
 
 		 344 aa  169  9e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  31.61 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  28.79 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.67 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  32.54 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.23 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  30.77 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.08 
 
 		 345 aa  166  6.9999999999999995e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.93 
 
 		 341 aa  165  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2842  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.4 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0875  heat-inducible transcription repressor  30.97 
 
 		 360 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0901  heat-inducible transcription repressor  30.97 
 
 		 360 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.48 
 
 		 357 aa  162  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  29.72 
 
 		 370 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.72 
 
 		 344 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.52 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.36 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.32 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.93 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.29 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  30.64 
 
 		 364 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.12 
 
 		 345 aa  155  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  28.05 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0438  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000928252  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  30.84 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  33.53 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  33.83 
 
 		 339 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0152  heat-inducible transcription repressor  33.73 
 
 		 362 aa  152  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.74 
 
 		 353 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.74 
 
 		 353 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  27.94 
 
 		 338 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  30.48 
 
 		 353 aa  151  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.84 
 
 		 355 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  34.23 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.53 
 
 		 351 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  27.94 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  28.96 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  28.96 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  31.95 
 
 		 352 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.85 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.24 
 
 		 365 aa  150  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  28.35 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>