43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10170 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_10170  protein translocase, SecG subunit  100 
 
 		 84 aa  163  6.9999999999999995e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000553201  hitchhiker  0.000000506561 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1753  preprotein translocase, SecG subunit  74.29 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000258746  normal  0.08391 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07170  protein translocase, SecG subunit  69.05 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000216048  normal  0.678062 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0921  preprotein translocase, SecG subunit  51.22 
 
 		 83 aa  87.4  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.255471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5605  preprotein translocase, SecG subunit  41.33 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278961  normal  0.762128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2983  preprotein translocase SecG subunit  44.26 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.536026  normal  0.0158601 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0852  preprotein translocase, SecG subunit  52.54 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2014  preprotein translocase subunit SecG  41.27 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6035  protein translocase subunit secG  52.73 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.977593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3007  preprotein translocase, SecG subunit  40 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1121  preprotein translocase, SecG subunit  43.14 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0046107 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2050  preprotein translocase, SecG subunit  39.58 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13140  protein translocase subunit secG  38.18 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2533  protein translocase subunit secG  39.19 
 
 		 76 aa  50.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1551  preprotein translocase, SecG subunit  36.99 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0434  preprotein translocase subunit SecG  41.82 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00104862  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1990  preprotein translocase subunit SecG  47.92 
 
 		 76 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372044  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2168  preprotein translocase, SecG subunit  38.33 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3953  preprotein translocase, SecG subunit  34.25 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0906  preprotein translocase, SecG subunit  38.78 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1259  preprotein translocase, SecG subunit  32.91 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0724  preprotein translocase subunit SecG  46.55 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.505164  normal  0.708301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3322  preprotein translocase, SecG subunit  38.33 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.363921  hitchhiker  0.00119755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2201  preprotein translocase, SecG subunit  40 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000169069  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2928  preprotein translocase subunit SecG  35.29 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11468  preprotein translocase subunit SecG  38.18 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000326275  normal  0.980006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3095  preprotein translocase, SecG subunit  40 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111238  normal  0.0631232 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3127  preprotein translocase subunit SecG  37.04 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2803  preprotein translocase, SecG subunit  36.76 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000076727  hitchhiker  0.00000696704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1940  preprotein translocase, SecG subunit  35.85 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.30341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2957  preprotein translocase subunit SecG  41.03 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000890053  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1640  preprotein translocase subunit SecG  38.33 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15900  preprotein translocase subunit SecG  43.75 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330495  normal  0.548909 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2545  preprotein translocase subunit SecG  43.1 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18351  preprotein translocase subunit SecG  46.43 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0967  preprotein translocase subunit SecG  45.61 
 
 		 76 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2447  preprotein translocase subunit SecG  34.55 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2453  preprotein translocase subunit SecG  34.55 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2090  preprotein translocase subunit SecG  43.75 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192234  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2407  preprotein translocase subunit SecG  34.55 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20000  protein translocase subunit secG  40 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1831  preprotein translocase subunit SecG  43.75 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888635 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2537  preprotein translocase, SecG subunit  43.75 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000769427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>