More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10130 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  100 
 
 
256 aa  525  1e-148  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  65.88 
 
 
257 aa  347  1e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  61.51 
 
 
256 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  54.37 
 
 
255 aa  278  6e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  53.39 
 
 
261 aa  265  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  51.98 
 
 
256 aa  251  5.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  50.8 
 
 
250 aa  245  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  49 
 
 
263 aa  242  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
253 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
687 aa  241  9e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 
252 aa  238  6.999999999999999e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
253 aa  238  9e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  50.2 
 
 
257 aa  238  9e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 
275 aa  237  2e-61  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  51.18 
 
 
253 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 
262 aa  236  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  48.59 
 
 
263 aa  236  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  48.43 
 
 
250 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 
248 aa  234  7e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  45.85 
 
 
253 aa  235  7e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  45.85 
 
 
253 aa  235  7e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  50 
 
 
263 aa  234  8e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  48.59 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  48.81 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  50 
 
 
253 aa  232  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  48.41 
 
 
250 aa  233  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 
253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 
252 aa  232  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 
261 aa  231  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 
251 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  49.02 
 
 
250 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  50 
 
 
250 aa  230  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
257 aa  229  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 
251 aa  229  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.94 
 
 
655 aa  229  4e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 
254 aa  228  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 
260 aa  228  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  48.59 
 
 
261 aa  228  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 
251 aa  228  9e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 
248 aa  228  9e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 
258 aa  228  9e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.27 
 
 
646 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 
255 aa  227  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 
261 aa  227  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
249 aa  227  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 
263 aa  227  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  44.66 
 
 
252 aa  226  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2169  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 
265 aa  226  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 
251 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 
261 aa  226  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 
254 aa  226  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 
251 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 
251 aa  225  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 
251 aa  225  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  48.03 
 
 
252 aa  226  4e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 
258 aa  225  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 
251 aa  225  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 
243 aa  225  6e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 
256 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  46 
 
 
265 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 
251 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 
251 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  50 
 
 
253 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  50 
 
 
253 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 
251 aa  223  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 
251 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  49.17 
 
 
243 aa  223  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  46.85 
 
 
251 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 
251 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  43.65 
 
 
252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 
249 aa  221  7e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 
248 aa  221  9e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 
248 aa  221  9e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  43.87 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 
250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0750  triosephosphate isomerase  41.77 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  45.2 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  48.81 
 
 
254 aa  219  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2705  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 
261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2929  Triose-phosphate isomerase  46.06 
 
 
261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 
251 aa  218  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 
264 aa  219  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 
264 aa  219  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  46.46 
 
 
251 aa  218  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2446  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 
261 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 
250 aa  216  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 
260 aa  216  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2406  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 
261 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2452  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 
261 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.487817 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 
250 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.22 
 
 
650 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11466  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 
261 aa  214  7e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000235283  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  46.06 
 
 
251 aa  214  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  43.75 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  43.25 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>