More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10010 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_10010  putative methyltransferase  100 
 
 
201 aa  402  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000171171  hitchhiker  0.00000036703 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  50.79 
 
 
197 aa  177  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05600  putative methyltransferase  48.7 
 
 
188 aa  167  9e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0859  methyltransferase  37.17 
 
 
192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  45.22 
 
 
189 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.51 
 
 
202 aa  114  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  42.22 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  42.17 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  42.95 
 
 
189 aa  112  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  43.33 
 
 
189 aa  111  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  48.8 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  48.89 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  38.17 
 
 
185 aa  109  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  42.41 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  41.51 
 
 
186 aa  108  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  43.75 
 
 
184 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  40.24 
 
 
186 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  44.19 
 
 
189 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.75 
 
 
207 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  44.62 
 
 
186 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  43.56 
 
 
191 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  43.48 
 
 
187 aa  105  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  39.38 
 
 
185 aa  105  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  39.29 
 
 
190 aa  104  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  37.89 
 
 
200 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  40.11 
 
 
188 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  38.46 
 
 
187 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  37.89 
 
 
200 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  32.98 
 
 
188 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  32.98 
 
 
188 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  32.98 
 
 
188 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  35.64 
 
 
190 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  32.98 
 
 
188 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  35.98 
 
 
186 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  32.98 
 
 
188 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  37.89 
 
 
200 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  41.61 
 
 
188 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  43.4 
 
 
188 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1746  hypothetical protein  40.91 
 
 
228 aa  102  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00357447  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  36.22 
 
 
185 aa  101  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  39.26 
 
 
184 aa  101  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  39.88 
 
 
185 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  35.5 
 
 
188 aa  101  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  41.86 
 
 
180 aa  101  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  42.31 
 
 
185 aa  101  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  43.08 
 
 
186 aa  101  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  38.61 
 
 
186 aa  101  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  46.51 
 
 
205 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  37.97 
 
 
187 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  35.5 
 
 
188 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  36.02 
 
 
200 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  44.88 
 
 
193 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  35.5 
 
 
188 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  34.91 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  37.97 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.31 
 
 
198 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  40.37 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  37.65 
 
 
179 aa  99.8  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  42.41 
 
 
189 aa  99  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  38.12 
 
 
200 aa  99  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  36.79 
 
 
187 aa  99  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  43.65 
 
 
193 aa  99  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  47.33 
 
 
180 aa  99.4  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  34.55 
 
 
187 aa  99.4  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  39.38 
 
 
188 aa  99  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  38.58 
 
 
197 aa  99.4  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2441  methyltransferase  36.71 
 
 
183 aa  98.6  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.585429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  39.26 
 
 
198 aa  99  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  37.65 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  42.24 
 
 
191 aa  98.6  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0714  hypothetical protein  35.12 
 
 
180 aa  98.2  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162596  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  34.55 
 
 
187 aa  98.2  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  36.2 
 
 
188 aa  98.2  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  38.34 
 
 
184 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  37.17 
 
 
188 aa  98.2  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3943  putative methyltransferase  40.31 
 
 
194 aa  98.2  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00817636  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  38.52 
 
 
185 aa  98.2  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  34.78 
 
 
206 aa  97.8  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  35.4 
 
 
187 aa  97.8  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  36.31 
 
 
198 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.31 
 
 
198 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  41.98 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  39.29 
 
 
212 aa  97.1  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.31 
 
 
198 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1564  methyltransferase  39.39 
 
 
229 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000859592  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  41.57 
 
 
183 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.31 
 
 
198 aa  97.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.31 
 
 
198 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  35.03 
 
 
191 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  36.22 
 
 
198 aa  97.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  36.71 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  37.89 
 
 
185 aa  97.1  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  35.83 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  36.88 
 
 
201 aa  96.3  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  32.46 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  32.93 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  35.03 
 
 
191 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  35.71 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.5 
 
 
199 aa  95.5  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>