More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10000 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1354  helicase domain protein  58.47 
 
 		 734 aa  761    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0209884  normal  0.12194 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05590  RecG-like helicase  56.61 
 
 		 741 aa  770    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.37968  normal  0.810679 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10000  RecG-like helicase  100 
 
 		 723 aa  1473    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000812963  hitchhiker  0.000000704574 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0860  helicase domain protein  45.44 
 
 		 730 aa  556  1e-157  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.313479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.14 
 
 		 681 aa  474  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.98 
 
 		 680 aa  470  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.95 
 
 		 685 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.53 
 
 		 694 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.31 
 
 		 685 aa  456  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.06 
 
 		 817 aa  456  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.95 
 
 		 689 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.06 
 
 		 815 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.03 
 
 		 683 aa  452  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  36.99 
 
 		 818 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.3 
 
 		 717 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.31 
 
 		 818 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.6 
 
 		 846 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.99 
 
 		 740 aa  439  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.33 
 
 		 846 aa  439  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.39 
 
 		 779 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.41 
 
 		 682 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.72 
 
 		 773 aa  439  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.39 
 
 		 812 aa  434  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.09 
 
 		 818 aa  434  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.93 
 
 		 776 aa  432  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.86 
 
 		 862 aa  431  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.66 
 
 		 682 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.61 
 
 		 827 aa  430  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.87 
 
 		 692 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.95 
 
 		 842 aa  428  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.53 
 
 		 842 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.06 
 
 		 772 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.02 
 
 		 819 aa  429  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.02 
 
 		 819 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.45 
 
 		 772 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.54 
 
 		 720 aa  427  1e-118  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.07 
 
 		 681 aa  427  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.68 
 
 		 832 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.36 
 
 		 787 aa  425  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.31 
 
 		 767 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.63 
 
 		 779 aa  425  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.77 
 
 		 763 aa  424  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.16 
 
 		 786 aa  422  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.29 
 
 		 822 aa  426  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.88 
 
 		 772 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0908  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.81 
 
 		 703 aa  422  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.55 
 
 		 829 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.81 
 
 		 700 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.45 
 
 		 781 aa  416  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.99 
 
 		 685 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.56 
 
 		 682 aa  415  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.42 
 
 		 682 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.27 
 
 		 682 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.47 
 
 		 679 aa  413  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.42 
 
 		 682 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1162  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.68 
 
 		 678 aa  413  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000110827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.42 
 
 		 682 aa  415  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.27 
 
 		 682 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.43 
 
 		 827 aa  414  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0771  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.6 
 
 		 679 aa  416  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000386747 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.42 
 
 		 682 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.85 
 
 		 682 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.33 
 
 		 908 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.77 
 
 		 688 aa  412  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.45 
 
 		 904 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.77 
 
 		 818 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0793  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.77 
 
 		 682 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  33 
 
 		 689 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.11 
 
 		 671 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.88 
 
 		 904 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.08 
 
 		 903 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1371  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.29 
 
 		 710 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.393956  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.36 
 
 		 706 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0536  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.2 
 
 		 676 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.1 
 
 		 707 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.66 
 
 		 657 aa  403  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.65 
 
 		 846 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09240  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.34 
 
 		 722 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0945523  normal  0.830238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2116  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.58 
 
 		 718 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48597 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.63 
 
 		 818 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.26 
 
 		 712 aa  405  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.41 
 
 		 706 aa  403  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.31 
 
 		 815 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1967  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.97 
 
 		 682 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0646  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.77 
 
 		 733 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3607  DEAD/DEAH box helicase-like  38.75 
 
 		 739 aa  402  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.18 
 
 		 805 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.01 
 
 		 672 aa  402  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.71 
 
 		 741 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.96 
 
 		 765 aa  398  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.48 
 
 		 706 aa  396  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.9 
 
 		 719 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.7 
 
 		 706 aa  399  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1311  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.86 
 
 		 686 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.43 
 
 		 703 aa  397  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.75 
 
 		 704 aa  399  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1286  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.86 
 
 		 686 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1330  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.76 
 
 		 678 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.1 
 
 		 714 aa  395  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.21 
 
 		 698 aa  395  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>