47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09960 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  100 
 
 		 242 aa  475  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000195212  hitchhiker  0.00000209899 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  33.61 
 
 		 240 aa  141  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  32.77 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  26.94 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0733  protein of unknown function DUF164  22.88 
 
 		 239 aa  62  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0821562  normal  0.949915 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  23.32 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  24.28 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  26.64 
 
 		 247 aa  52  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  23.17 
 
 		 246 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  23.39 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  22.13 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  27.98 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  23.58 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  25 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  24.69 
 
 		 237 aa  49.7  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  27.2 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  26.67 
 
 		 262 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  25.96 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  29.87 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  23.46 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  22.3 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  26.67 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  24.08 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  25.81 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  26.67 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  26.67 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  23.67 
 
 		 238 aa  45.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  29.46 
 
 		 237 aa  45.4  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  21.46 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  26.23 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  21.49 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  25.53 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  28.44 
 
 		 116 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.21 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  31.6 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  20.41 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  22.27 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  29.14 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  22.95 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  35 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  23.77 
 
 		 244 aa  42.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  30.94 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  20.99 
 
 		 246 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  23.24 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  22.17 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  24.64 
 
 		 235 aa  42  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  27.08 
 
 		 234 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>